Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp22Q5DU02 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp22Q5DU02 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp22Q5DU02 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp22Q5DU02 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp22Q5DU02 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp22Q5DU02 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp22Q5DU02 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp22Q5DU02 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp22Q5DU02 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp22Q5DU02 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp22Q5DU02 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp22Q5DU02 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp22Q5DU02 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp22Q5DU02 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp22Q5DU02 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp22Q5DU02 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp22Q5DU02 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp22Q5DU02 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp22Q5DU02 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp22Q5DU02 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp22Q5DU02 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp22Q5DU02 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp22Q5DU02 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp22Q5DU02 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp22Q5DU02 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp22Q5DU02 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp22Q5DU02 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp22Q5DU02 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp22Q5DU02 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp22Q5DU02 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp22Q5DU02 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp22Q5DU02 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp22Q5DU02 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp22Q5DU02 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp22Q5DU02 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp22Q5DU02 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp22Q5DU02 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp22Q5DU02 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp22Q5DU02 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp22Q5DU02 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp22Q5DU02 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp22Q5DU02 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp22Q5DU02 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp22Q5DU02 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp22Q5DU02 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp22Q5DU02 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp22Q5DU02 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp22Q5DU02 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp22Q5DU02 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp22Q5DU02 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp22Q5DU02 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp22Q5DU02 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp22Q5DU02 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp22Q5DU02 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp22Q5DU02 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp22Q5DU02 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp22Q5DU02 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp22Q5DU02 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp22Q5DU02 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp22Q5DU02 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp22Q5DU02 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp22Q5DU02 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp22Q5DU02 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp22Q5DU02 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp22Q5DU02 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp22Q5DU02 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp22Q5DU02 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp22Q5DU02 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp22Q5DU02 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp22Q5DU02 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp22Q5DU02 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp22Q5DU02 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp22Q5DU02 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp22Q5DU02 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp22Q5DU02 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp22Q5DU02 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp22Q5DU02 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp22Q5DU02 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp22Q5DU02 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp22Q5DU02 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp22Q5DU02 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp22Q5DU02 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp22Q5DU02 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp22Q5DU02 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp22Q5DU02 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp22Q5DU02 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp22Q5DU02 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp22Q5DU02 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp22Q5DU02 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp22Q5DU02 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp22Q5DU02 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp22Q5DU02 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp22Q5DU02 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp22Q5DU02 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp22Q5DU02 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp22Q5DU02 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp22Q5DU02 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp22Q5DU02 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp22Q5DU02 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms