Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam208bQ5DTT3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam208bQ5DTT3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam208bQ5DTT3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam208bQ5DTT3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam208bQ5DTT3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam208bQ5DTT3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam208bQ5DTT3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam208bQ5DTT3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam208bQ5DTT3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam208bQ5DTT3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam208bQ5DTT3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam208bQ5DTT3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam208bQ5DTT3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam208bQ5DTT3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam208bQ5DTT3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam208bQ5DTT3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam208bQ5DTT3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam208bQ5DTT3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam208bQ5DTT3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam208bQ5DTT3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam208bQ5DTT3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam208bQ5DTT3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam208bQ5DTT3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam208bQ5DTT3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam208bQ5DTT3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam208bQ5DTT3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam208bQ5DTT3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Fam208bQ5DTT3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam208bQ5DTT3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam208bQ5DTT3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam208bQ5DTT3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam208bQ5DTT3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam208bQ5DTT3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam208bQ5DTT3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam208bQ5DTT3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam208bQ5DTT3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam208bQ5DTT3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam208bQ5DTT3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam208bQ5DTT3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam208bQ5DTT3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam208bQ5DTT3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam208bQ5DTT3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam208bQ5DTT3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam208bQ5DTT3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam208bQ5DTT3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam208bQ5DTT3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam208bQ5DTT3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms