Protein–RNA interactions for Protein: Q504N7

Pyrin and HIN domain-containing protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q504N7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q504N7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q504N7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q504N7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q504N7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Q504N7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q504N7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q504N7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q504N7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q504N7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q504N7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q504N7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q504N7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q504N7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q504N7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q504N7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q504N7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q504N7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Q504N7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q504N7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q504N7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q504N7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q504N7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q504N7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q504N7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q504N7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q504N7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q504N7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q504N7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q504N7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Q504N7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q504N7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q504N7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q504N7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q504N7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q504N7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q504N7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q504N7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q504N7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q504N7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q504N7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q504N7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q504N7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q504N7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q504N7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q504N7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q504N7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q504N7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q504N7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q504N7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q504N7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q504N7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q504N7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q504N7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q504N7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q504N7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q504N7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q504N7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q504N7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q504N7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q504N7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q504N7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q504N7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q504N7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q504N7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q504N7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q504N7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q504N7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q504N7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q504N7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q504N7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q504N7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q504N7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q504N7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q504N7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q504N7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Q504N7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q504N7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q504N7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q504N7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Q504N7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q504N7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q504N7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q504N7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q504N7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q504N7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q504N7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q504N7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q504N7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q504N7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q504N7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q504N7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q504N7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q504N7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q504N7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q504N7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q504N7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q504N7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q504N7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q504N7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms