Protein–RNA interactions for Protein: Q501J7

Phactr4, Phosphatase and actin regulator 4, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr4Q501J7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phactr4Q501J7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phactr4Q501J7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phactr4Q501J7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phactr4Q501J7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Phactr4Q501J7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phactr4Q501J7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phactr4Q501J7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phactr4Q501J7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phactr4Q501J7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phactr4Q501J7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phactr4Q501J7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phactr4Q501J7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phactr4Q501J7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phactr4Q501J7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phactr4Q501J7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phactr4Q501J7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phactr4Q501J7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phactr4Q501J7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phactr4Q501J7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phactr4Q501J7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phactr4Q501J7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phactr4Q501J7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phactr4Q501J7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phactr4Q501J7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phactr4Q501J7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phactr4Q501J7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phactr4Q501J7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phactr4Q501J7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phactr4Q501J7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phactr4Q501J7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Phactr4Q501J7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phactr4Q501J7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phactr4Q501J7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phactr4Q501J7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phactr4Q501J7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phactr4Q501J7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phactr4Q501J7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phactr4Q501J7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Phactr4Q501J7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phactr4Q501J7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phactr4Q501J7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phactr4Q501J7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phactr4Q501J7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phactr4Q501J7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phactr4Q501J7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Phactr4Q501J7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phactr4Q501J7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phactr4Q501J7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phactr4Q501J7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phactr4Q501J7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phactr4Q501J7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phactr4Q501J7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phactr4Q501J7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phactr4Q501J7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phactr4Q501J7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phactr4Q501J7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phactr4Q501J7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phactr4Q501J7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phactr4Q501J7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phactr4Q501J7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phactr4Q501J7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phactr4Q501J7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phactr4Q501J7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phactr4Q501J7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phactr4Q501J7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phactr4Q501J7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phactr4Q501J7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phactr4Q501J7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phactr4Q501J7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phactr4Q501J7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phactr4Q501J7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Phactr4Q501J7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phactr4Q501J7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phactr4Q501J7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phactr4Q501J7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phactr4Q501J7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phactr4Q501J7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phactr4Q501J7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phactr4Q501J7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phactr4Q501J7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phactr4Q501J7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phactr4Q501J7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phactr4Q501J7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phactr4Q501J7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phactr4Q501J7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phactr4Q501J7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phactr4Q501J7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phactr4Q501J7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phactr4Q501J7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phactr4Q501J7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phactr4Q501J7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phactr4Q501J7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phactr4Q501J7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phactr4Q501J7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phactr4Q501J7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phactr4Q501J7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phactr4Q501J7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phactr4Q501J7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phactr4Q501J7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms