Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJN1

C1qtnf9, Complement C1q and tumor necrosis factor-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf9Q4ZJN1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1qtnf9Q4ZJN1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1qtnf9Q4ZJN1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1qtnf9Q4ZJN1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1qtnf9Q4ZJN1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1qtnf9Q4ZJN1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1qtnf9Q4ZJN1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1qtnf9Q4ZJN1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1qtnf9Q4ZJN1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1qtnf9Q4ZJN1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1qtnf9Q4ZJN1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1qtnf9Q4ZJN1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1qtnf9Q4ZJN1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C1qtnf9Q4ZJN1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1qtnf9Q4ZJN1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C1qtnf9Q4ZJN1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1qtnf9Q4ZJN1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C1qtnf9Q4ZJN1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
C1qtnf9Q4ZJN1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1qtnf9Q4ZJN1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1qtnf9Q4ZJN1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1qtnf9Q4ZJN1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1qtnf9Q4ZJN1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1qtnf9Q4ZJN1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1qtnf9Q4ZJN1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1qtnf9Q4ZJN1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1qtnf9Q4ZJN1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1qtnf9Q4ZJN1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1qtnf9Q4ZJN1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1qtnf9Q4ZJN1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1qtnf9Q4ZJN1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1qtnf9Q4ZJN1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1qtnf9Q4ZJN1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1qtnf9Q4ZJN1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1qtnf9Q4ZJN1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1qtnf9Q4ZJN1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1qtnf9Q4ZJN1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1qtnf9Q4ZJN1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1qtnf9Q4ZJN1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1qtnf9Q4ZJN1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C1qtnf9Q4ZJN1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C1qtnf9Q4ZJN1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C1qtnf9Q4ZJN1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1qtnf9Q4ZJN1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C1qtnf9Q4ZJN1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1qtnf9Q4ZJN1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1qtnf9Q4ZJN1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1qtnf9Q4ZJN1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C1qtnf9Q4ZJN1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1qtnf9Q4ZJN1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C1qtnf9Q4ZJN1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C1qtnf9Q4ZJN1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C1qtnf9Q4ZJN1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1qtnf9Q4ZJN1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1qtnf9Q4ZJN1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1qtnf9Q4ZJN1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1qtnf9Q4ZJN1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1qtnf9Q4ZJN1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1qtnf9Q4ZJN1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1qtnf9Q4ZJN1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1qtnf9Q4ZJN1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1qtnf9Q4ZJN1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1qtnf9Q4ZJN1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1qtnf9Q4ZJN1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1qtnf9Q4ZJN1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1qtnf9Q4ZJN1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
C1qtnf9Q4ZJN1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1qtnf9Q4ZJN1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1qtnf9Q4ZJN1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1qtnf9Q4ZJN1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1qtnf9Q4ZJN1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C1qtnf9Q4ZJN1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C1qtnf9Q4ZJN1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C1qtnf9Q4ZJN1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C1qtnf9Q4ZJN1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C1qtnf9Q4ZJN1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms