Protein–RNA interactions for Protein: Q4KN81

H2-Q2, Histocompatibility 2, Q region locus 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q2Q4KN81 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-Q2Q4KN81 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-Q2Q4KN81 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-Q2Q4KN81 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-Q2Q4KN81 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2-Q2Q4KN81 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2-Q2Q4KN81 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2-Q2Q4KN81 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2-Q2Q4KN81 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2-Q2Q4KN81 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2-Q2Q4KN81 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2-Q2Q4KN81 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2-Q2Q4KN81 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2-Q2Q4KN81 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2-Q2Q4KN81 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2-Q2Q4KN81 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2-Q2Q4KN81 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2-Q2Q4KN81 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2-Q2Q4KN81 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2-Q2Q4KN81 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2-Q2Q4KN81 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2-Q2Q4KN81 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2-Q2Q4KN81 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2-Q2Q4KN81 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2-Q2Q4KN81 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2-Q2Q4KN81 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2-Q2Q4KN81 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2-Q2Q4KN81 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2-Q2Q4KN81 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2-Q2Q4KN81 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
H2-Q2Q4KN81 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2-Q2Q4KN81 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2-Q2Q4KN81 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2-Q2Q4KN81 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2-Q2Q4KN81 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
H2-Q2Q4KN81 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2-Q2Q4KN81 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2-Q2Q4KN81 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
H2-Q2Q4KN81 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2-Q2Q4KN81 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2-Q2Q4KN81 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2-Q2Q4KN81 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2-Q2Q4KN81 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2-Q2Q4KN81 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2-Q2Q4KN81 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
H2-Q2Q4KN81 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H2-Q2Q4KN81 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H2-Q2Q4KN81 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H2-Q2Q4KN81 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
H2-Q2Q4KN81 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H2-Q2Q4KN81 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H2-Q2Q4KN81 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2-Q2Q4KN81 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
H2-Q2Q4KN81 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2-Q2Q4KN81 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2-Q2Q4KN81 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2-Q2Q4KN81 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2-Q2Q4KN81 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2-Q2Q4KN81 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2-Q2Q4KN81 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2-Q2Q4KN81 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2-Q2Q4KN81 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2-Q2Q4KN81 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2-Q2Q4KN81 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2-Q2Q4KN81 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2-Q2Q4KN81 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2-Q2Q4KN81 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2-Q2Q4KN81 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2-Q2Q4KN81 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2-Q2Q4KN81 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2-Q2Q4KN81 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2-Q2Q4KN81 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
H2-Q2Q4KN81 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2-Q2Q4KN81 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2-Q2Q4KN81 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2-Q2Q4KN81 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2-Q2Q4KN81 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2-Q2Q4KN81 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2-Q2Q4KN81 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2-Q2Q4KN81 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2-Q2Q4KN81 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2-Q2Q4KN81 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2-Q2Q4KN81 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
H2-Q2Q4KN81 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2-Q2Q4KN81 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2-Q2Q4KN81 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2-Q2Q4KN81 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2-Q2Q4KN81 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2-Q2Q4KN81 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2-Q2Q4KN81 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2-Q2Q4KN81 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2-Q2Q4KN81 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2-Q2Q4KN81 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2-Q2Q4KN81 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-Q2Q4KN81 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-Q2Q4KN81 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-Q2Q4KN81 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-Q2Q4KN81 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-Q2Q4KN81 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2-Q2Q4KN81 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms