Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trappc3lQ4KL14 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trappc3lQ4KL14 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trappc3lQ4KL14 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trappc3lQ4KL14 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trappc3lQ4KL14 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trappc3lQ4KL14 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trappc3lQ4KL14 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc3lQ4KL14 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc3lQ4KL14 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc3lQ4KL14 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc3lQ4KL14 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc3lQ4KL14 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trappc3lQ4KL14 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trappc3lQ4KL14 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trappc3lQ4KL14 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trappc3lQ4KL14 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trappc3lQ4KL14 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trappc3lQ4KL14 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trappc3lQ4KL14 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trappc3lQ4KL14 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trappc3lQ4KL14 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trappc3lQ4KL14 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trappc3lQ4KL14 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Trappc3lQ4KL14 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trappc3lQ4KL14 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trappc3lQ4KL14 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trappc3lQ4KL14 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trappc3lQ4KL14 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc3lQ4KL14 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc3lQ4KL14 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc3lQ4KL14 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc3lQ4KL14 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc3lQ4KL14 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc3lQ4KL14 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc3lQ4KL14 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc3lQ4KL14 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trappc3lQ4KL14 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trappc3lQ4KL14 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trappc3lQ4KL14 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trappc3lQ4KL14 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Trappc3lQ4KL14 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trappc3lQ4KL14 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trappc3lQ4KL14 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trappc3lQ4KL14 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trappc3lQ4KL14 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trappc3lQ4KL14 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trappc3lQ4KL14 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trappc3lQ4KL14 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trappc3lQ4KL14 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc3lQ4KL14 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc3lQ4KL14 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc3lQ4KL14 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc3lQ4KL14 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc3lQ4KL14 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc3lQ4KL14 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc3lQ4KL14 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trappc3lQ4KL14 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trappc3lQ4KL14 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trappc3lQ4KL14 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trappc3lQ4KL14 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trappc3lQ4KL14 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trappc3lQ4KL14 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trappc3lQ4KL14 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trappc3lQ4KL14 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trappc3lQ4KL14 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Trappc3lQ4KL14 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Trappc3lQ4KL14 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trappc3lQ4KL14 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trappc3lQ4KL14 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trappc3lQ4KL14 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trappc3lQ4KL14 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trappc3lQ4KL14 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trappc3lQ4KL14 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trappc3lQ4KL14 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trappc3lQ4KL14 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trappc3lQ4KL14 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trappc3lQ4KL14 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trappc3lQ4KL14 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Trappc3lQ4KL14 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trappc3lQ4KL14 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trappc3lQ4KL14 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trappc3lQ4KL14 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trappc3lQ4KL14 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trappc3lQ4KL14 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trappc3lQ4KL14 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trappc3lQ4KL14 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trappc3lQ4KL14 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trappc3lQ4KL14 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trappc3lQ4KL14 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trappc3lQ4KL14 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trappc3lQ4KL14 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trappc3lQ4KL14 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trappc3lQ4KL14 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trappc3lQ4KL14 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trappc3lQ4KL14 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trappc3lQ4KL14 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trappc3lQ4KL14 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trappc3lQ4KL14 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trappc3lQ4KL14 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms