Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ckap2Q3V1H1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ckap2Q3V1H1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ckap2Q3V1H1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ckap2Q3V1H1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ckap2Q3V1H1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ckap2Q3V1H1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ckap2Q3V1H1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ckap2Q3V1H1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ckap2Q3V1H1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ckap2Q3V1H1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ckap2Q3V1H1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ckap2Q3V1H1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Ckap2Q3V1H1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ckap2Q3V1H1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ckap2Q3V1H1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ckap2Q3V1H1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ckap2Q3V1H1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ckap2Q3V1H1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ckap2Q3V1H1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ckap2Q3V1H1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ckap2Q3V1H1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ckap2Q3V1H1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ckap2Q3V1H1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ckap2Q3V1H1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ckap2Q3V1H1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ckap2Q3V1H1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ckap2Q3V1H1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ckap2Q3V1H1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ckap2Q3V1H1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ckap2Q3V1H1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ckap2Q3V1H1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ckap2Q3V1H1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ckap2Q3V1H1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ckap2Q3V1H1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ckap2Q3V1H1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ckap2Q3V1H1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ckap2Q3V1H1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ckap2Q3V1H1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ckap2Q3V1H1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ckap2Q3V1H1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ckap2Q3V1H1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ckap2Q3V1H1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ckap2Q3V1H1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ckap2Q3V1H1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ckap2Q3V1H1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ckap2Q3V1H1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ckap2Q3V1H1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ckap2Q3V1H1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ckap2Q3V1H1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ckap2Q3V1H1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ckap2Q3V1H1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ckap2Q3V1H1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ckap2Q3V1H1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ckap2Q3V1H1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ckap2Q3V1H1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ckap2Q3V1H1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ckap2Q3V1H1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ckap2Q3V1H1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ckap2Q3V1H1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ckap2Q3V1H1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ckap2Q3V1H1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ckap2Q3V1H1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ckap2Q3V1H1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ckap2Q3V1H1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ckap2Q3V1H1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ckap2Q3V1H1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ckap2Q3V1H1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ckap2Q3V1H1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ckap2Q3V1H1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ckap2Q3V1H1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ckap2Q3V1H1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ckap2Q3V1H1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ckap2Q3V1H1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ckap2Q3V1H1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ckap2Q3V1H1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ckap2Q3V1H1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ckap2Q3V1H1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ckap2Q3V1H1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ckap2Q3V1H1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ckap2Q3V1H1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ckap2Q3V1H1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ckap2Q3V1H1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ckap2Q3V1H1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ckap2Q3V1H1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ckap2Q3V1H1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ckap2Q3V1H1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ckap2Q3V1H1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ckap2Q3V1H1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ckap2Q3V1H1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ckap2Q3V1H1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ckap2Q3V1H1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ckap2Q3V1H1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ckap2Q3V1H1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ckap2Q3V1H1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ckap2Q3V1H1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ckap2Q3V1H1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ckap2Q3V1H1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ckap2Q3V1H1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ckap2Q3V1H1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms