Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc185Q3V118 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc185Q3V118 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc185Q3V118 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc185Q3V118 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc185Q3V118 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc185Q3V118 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc185Q3V118 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc185Q3V118 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc185Q3V118 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc185Q3V118 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc185Q3V118 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc185Q3V118 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc185Q3V118 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc185Q3V118 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc185Q3V118 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc185Q3V118 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc185Q3V118 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc185Q3V118 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc185Q3V118 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc185Q3V118 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc185Q3V118 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc185Q3V118 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc185Q3V118 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc185Q3V118 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc185Q3V118 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc185Q3V118 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc185Q3V118 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc185Q3V118 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc185Q3V118 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc185Q3V118 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc185Q3V118 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc185Q3V118 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc185Q3V118 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc185Q3V118 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc185Q3V118 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc185Q3V118 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc185Q3V118 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc185Q3V118 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc185Q3V118 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc185Q3V118 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc185Q3V118 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc185Q3V118 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc185Q3V118 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc185Q3V118 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc185Q3V118 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc185Q3V118 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc185Q3V118 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc185Q3V118 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc185Q3V118 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc185Q3V118 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc185Q3V118 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc185Q3V118 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc185Q3V118 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc185Q3V118 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc185Q3V118 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc185Q3V118 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc185Q3V118 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc185Q3V118 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc185Q3V118 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc185Q3V118 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc185Q3V118 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc185Q3V118 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc185Q3V118 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc185Q3V118 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc185Q3V118 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc185Q3V118 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc185Q3V118 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc185Q3V118 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc185Q3V118 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc185Q3V118 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc185Q3V118 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc185Q3V118 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc185Q3V118 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc185Q3V118 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc185Q3V118 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc185Q3V118 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc185Q3V118 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc185Q3V118 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc185Q3V118 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc185Q3V118 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc185Q3V118 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc185Q3V118 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc185Q3V118 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc185Q3V118 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc185Q3V118 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc185Q3V118 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc185Q3V118 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc185Q3V118 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc185Q3V118 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc185Q3V118 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc185Q3V118 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc185Q3V118 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc185Q3V118 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc185Q3V118 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc185Q3V118 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc185Q3V118 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc185Q3V118 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc185Q3V118 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc185Q3V118 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms