Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Y1

Ppp4r3c, Protein PPP4R3C, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3cQ3V0Y1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppp4r3cQ3V0Y1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppp4r3cQ3V0Y1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp4r3cQ3V0Y1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppp4r3cQ3V0Y1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppp4r3cQ3V0Y1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp4r3cQ3V0Y1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp4r3cQ3V0Y1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp4r3cQ3V0Y1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp4r3cQ3V0Y1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp4r3cQ3V0Y1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp4r3cQ3V0Y1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp4r3cQ3V0Y1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp4r3cQ3V0Y1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp4r3cQ3V0Y1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp4r3cQ3V0Y1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppp4r3cQ3V0Y1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppp4r3cQ3V0Y1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppp4r3cQ3V0Y1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp4r3cQ3V0Y1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp4r3cQ3V0Y1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp4r3cQ3V0Y1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp4r3cQ3V0Y1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp4r3cQ3V0Y1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp4r3cQ3V0Y1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp4r3cQ3V0Y1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp4r3cQ3V0Y1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp4r3cQ3V0Y1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp4r3cQ3V0Y1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp4r3cQ3V0Y1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp4r3cQ3V0Y1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms