Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr1d1Q3UV55 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr1d1Q3UV55 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr1d1Q3UV55 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr1d1Q3UV55 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nr1d1Q3UV55 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nr1d1Q3UV55 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nr1d1Q3UV55 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nr1d1Q3UV55 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nr1d1Q3UV55 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nr1d1Q3UV55 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nr1d1Q3UV55 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nr1d1Q3UV55 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr1d1Q3UV55 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr1d1Q3UV55 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr1d1Q3UV55 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr1d1Q3UV55 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr1d1Q3UV55 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr1d1Q3UV55 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr1d1Q3UV55 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nr1d1Q3UV55 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nr1d1Q3UV55 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Nr1d1Q3UV55 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nr1d1Q3UV55 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nr1d1Q3UV55 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nr1d1Q3UV55 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Nr1d1Q3UV55 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr1d1Q3UV55 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr1d1Q3UV55 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr1d1Q3UV55 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr1d1Q3UV55 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr1d1Q3UV55 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr1d1Q3UV55 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nr1d1Q3UV55 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nr1d1Q3UV55 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nr1d1Q3UV55 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nr1d1Q3UV55 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nr1d1Q3UV55 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nr1d1Q3UV55 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nr1d1Q3UV55 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nr1d1Q3UV55 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nr1d1Q3UV55 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nr1d1Q3UV55 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nr1d1Q3UV55 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nr1d1Q3UV55 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nr1d1Q3UV55 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nr1d1Q3UV55 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nr1d1Q3UV55 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nr1d1Q3UV55 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nr1d1Q3UV55 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr1d1Q3UV55 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr1d1Q3UV55 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr1d1Q3UV55 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr1d1Q3UV55 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr1d1Q3UV55 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr1d1Q3UV55 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr1d1Q3UV55 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr1d1Q3UV55 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr1d1Q3UV55 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr1d1Q3UV55 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr1d1Q3UV55 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nr1d1Q3UV55 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nr1d1Q3UV55 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nr1d1Q3UV55 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nr1d1Q3UV55 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nr1d1Q3UV55 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nr1d1Q3UV55 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nr1d1Q3UV55 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nr1d1Q3UV55 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nr1d1Q3UV55 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nr1d1Q3UV55 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nr1d1Q3UV55 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nr1d1Q3UV55 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nr1d1Q3UV55 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nr1d1Q3UV55 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nr1d1Q3UV55 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nr1d1Q3UV55 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nr1d1Q3UV55 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nr1d1Q3UV55 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nr1d1Q3UV55 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nr1d1Q3UV55 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nr1d1Q3UV55 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nr1d1Q3UV55 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nr1d1Q3UV55 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nr1d1Q3UV55 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nr1d1Q3UV55 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nr1d1Q3UV55 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nr1d1Q3UV55 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nr1d1Q3UV55 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nr1d1Q3UV55 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nr1d1Q3UV55 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nr1d1Q3UV55 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nr1d1Q3UV55 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nr1d1Q3UV55 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nr1d1Q3UV55 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nr1d1Q3UV55 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nr1d1Q3UV55 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nr1d1Q3UV55 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nr1d1Q3UV55 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nr1d1Q3UV55 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.9 ms