Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Klhdc9Q3USL1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Klhdc9Q3USL1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Klhdc9Q3USL1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Klhdc9Q3USL1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Klhdc9Q3USL1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Klhdc9Q3USL1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Klhdc9Q3USL1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Klhdc9Q3USL1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Klhdc9Q3USL1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Klhdc9Q3USL1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Klhdc9Q3USL1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Klhdc9Q3USL1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Klhdc9Q3USL1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Klhdc9Q3USL1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Klhdc9Q3USL1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Klhdc9Q3USL1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Klhdc9Q3USL1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Klhdc9Q3USL1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Klhdc9Q3USL1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Klhdc9Q3USL1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Klhdc9Q3USL1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Klhdc9Q3USL1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Klhdc9Q3USL1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Klhdc9Q3USL1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Klhdc9Q3USL1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Klhdc9Q3USL1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Klhdc9Q3USL1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Klhdc9Q3USL1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Klhdc9Q3USL1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Klhdc9Q3USL1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Klhdc9Q3USL1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Klhdc9Q3USL1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Klhdc9Q3USL1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Klhdc9Q3USL1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Klhdc9Q3USL1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Klhdc9Q3USL1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Klhdc9Q3USL1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Klhdc9Q3USL1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Klhdc9Q3USL1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Klhdc9Q3USL1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Klhdc9Q3USL1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Klhdc9Q3USL1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Klhdc9Q3USL1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Klhdc9Q3USL1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Klhdc9Q3USL1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Klhdc9Q3USL1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Klhdc9Q3USL1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Klhdc9Q3USL1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Klhdc9Q3USL1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Klhdc9Q3USL1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Klhdc9Q3USL1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Klhdc9Q3USL1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Klhdc9Q3USL1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Klhdc9Q3USL1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Klhdc9Q3USL1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Klhdc9Q3USL1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Klhdc9Q3USL1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Klhdc9Q3USL1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Klhdc9Q3USL1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Klhdc9Q3USL1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Klhdc9Q3USL1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Klhdc9Q3USL1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Klhdc9Q3USL1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Klhdc9Q3USL1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Klhdc9Q3USL1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Klhdc9Q3USL1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Klhdc9Q3USL1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Klhdc9Q3USL1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Klhdc9Q3USL1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Klhdc9Q3USL1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Klhdc9Q3USL1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Klhdc9Q3USL1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Klhdc9Q3USL1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Klhdc9Q3USL1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Klhdc9Q3USL1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Klhdc9Q3USL1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Klhdc9Q3USL1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Klhdc9Q3USL1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Klhdc9Q3USL1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Klhdc9Q3USL1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Klhdc9Q3USL1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Klhdc9Q3USL1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Klhdc9Q3USL1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Klhdc9Q3USL1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Klhdc9Q3USL1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Klhdc9Q3USL1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Klhdc9Q3USL1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Klhdc9Q3USL1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Klhdc9Q3USL1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Klhdc9Q3USL1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Klhdc9Q3USL1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Klhdc9Q3USL1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Klhdc9Q3USL1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Klhdc9Q3USL1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Klhdc9Q3USL1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Klhdc9Q3USL1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Klhdc9Q3USL1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Klhdc9Q3USL1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Klhdc9Q3USL1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms