Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQI9

Mindy4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy4Q3UQI9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mindy4Q3UQI9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mindy4Q3UQI9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mindy4Q3UQI9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mindy4Q3UQI9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Mindy4Q3UQI9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mindy4Q3UQI9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Mindy4Q3UQI9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mindy4Q3UQI9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mindy4Q3UQI9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mindy4Q3UQI9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mindy4Q3UQI9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mindy4Q3UQI9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mindy4Q3UQI9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mindy4Q3UQI9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mindy4Q3UQI9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Mindy4Q3UQI9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mindy4Q3UQI9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mindy4Q3UQI9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mindy4Q3UQI9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mindy4Q3UQI9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mindy4Q3UQI9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mindy4Q3UQI9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mindy4Q3UQI9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mindy4Q3UQI9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mindy4Q3UQI9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mindy4Q3UQI9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mindy4Q3UQI9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mindy4Q3UQI9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mindy4Q3UQI9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mindy4Q3UQI9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mindy4Q3UQI9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mindy4Q3UQI9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mindy4Q3UQI9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Mindy4Q3UQI9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mindy4Q3UQI9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mindy4Q3UQI9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mindy4Q3UQI9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mindy4Q3UQI9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mindy4Q3UQI9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mindy4Q3UQI9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mindy4Q3UQI9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mindy4Q3UQI9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mindy4Q3UQI9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mindy4Q3UQI9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mindy4Q3UQI9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mindy4Q3UQI9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mindy4Q3UQI9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Mindy4Q3UQI9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mindy4Q3UQI9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mindy4Q3UQI9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mindy4Q3UQI9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mindy4Q3UQI9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mindy4Q3UQI9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mindy4Q3UQI9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Mindy4Q3UQI9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mindy4Q3UQI9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mindy4Q3UQI9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mindy4Q3UQI9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mindy4Q3UQI9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mindy4Q3UQI9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mindy4Q3UQI9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mindy4Q3UQI9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mindy4Q3UQI9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mindy4Q3UQI9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mindy4Q3UQI9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mindy4Q3UQI9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mindy4Q3UQI9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mindy4Q3UQI9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mindy4Q3UQI9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Mindy4Q3UQI9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Mindy4Q3UQI9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mindy4Q3UQI9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mindy4Q3UQI9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mindy4Q3UQI9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mindy4Q3UQI9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mindy4Q3UQI9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mindy4Q3UQI9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mindy4Q3UQI9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mindy4Q3UQI9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mindy4Q3UQI9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mindy4Q3UQI9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mindy4Q3UQI9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mindy4Q3UQI9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mindy4Q3UQI9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mindy4Q3UQI9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mindy4Q3UQI9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mindy4Q3UQI9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mindy4Q3UQI9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mindy4Q3UQI9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Mindy4Q3UQI9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mindy4Q3UQI9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mindy4Q3UQI9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mindy4Q3UQI9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mindy4Q3UQI9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mindy4Q3UQI9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mindy4Q3UQI9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mindy4Q3UQI9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mindy4Q3UQI9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mindy4Q3UQI9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms