Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms