Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH1

Prrc1, Protein PRRC1, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc1Q3UPH1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrc1Q3UPH1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrc1Q3UPH1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrc1Q3UPH1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrc1Q3UPH1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrc1Q3UPH1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrc1Q3UPH1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrc1Q3UPH1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrc1Q3UPH1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrc1Q3UPH1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrc1Q3UPH1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrc1Q3UPH1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Prrc1Q3UPH1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Prrc1Q3UPH1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Prrc1Q3UPH1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrc1Q3UPH1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrc1Q3UPH1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrc1Q3UPH1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrc1Q3UPH1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrc1Q3UPH1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrc1Q3UPH1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrc1Q3UPH1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrc1Q3UPH1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrc1Q3UPH1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrc1Q3UPH1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrc1Q3UPH1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrc1Q3UPH1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrc1Q3UPH1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrc1Q3UPH1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrc1Q3UPH1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrc1Q3UPH1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrc1Q3UPH1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrc1Q3UPH1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrc1Q3UPH1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrc1Q3UPH1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrc1Q3UPH1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrc1Q3UPH1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrc1Q3UPH1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrc1Q3UPH1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrc1Q3UPH1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrc1Q3UPH1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrc1Q3UPH1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrc1Q3UPH1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrc1Q3UPH1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrc1Q3UPH1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrc1Q3UPH1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrc1Q3UPH1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrc1Q3UPH1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrc1Q3UPH1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrc1Q3UPH1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrc1Q3UPH1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prrc1Q3UPH1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prrc1Q3UPH1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prrc1Q3UPH1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Prrc1Q3UPH1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prrc1Q3UPH1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prrc1Q3UPH1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prrc1Q3UPH1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prrc1Q3UPH1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Prrc1Q3UPH1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prrc1Q3UPH1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prrc1Q3UPH1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Prrc1Q3UPH1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prrc1Q3UPH1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prrc1Q3UPH1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prrc1Q3UPH1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prrc1Q3UPH1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prrc1Q3UPH1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prrc1Q3UPH1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prrc1Q3UPH1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prrc1Q3UPH1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prrc1Q3UPH1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prrc1Q3UPH1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prrc1Q3UPH1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Prrc1Q3UPH1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prrc1Q3UPH1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prrc1Q3UPH1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prrc1Q3UPH1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrc1Q3UPH1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrc1Q3UPH1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrc1Q3UPH1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrc1Q3UPH1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrc1Q3UPH1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrc1Q3UPH1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrc1Q3UPH1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrc1Q3UPH1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrc1Q3UPH1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrc1Q3UPH1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrc1Q3UPH1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrc1Q3UPH1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrc1Q3UPH1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrc1Q3UPH1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrc1Q3UPH1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrc1Q3UPH1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrc1Q3UPH1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrc1Q3UPH1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrc1Q3UPH1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrc1Q3UPH1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrc1Q3UPH1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrc1Q3UPH1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms