Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP38

Cracr2a, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2aQ3UP38 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cracr2aQ3UP38 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cracr2aQ3UP38 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cracr2aQ3UP38 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cracr2aQ3UP38 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cracr2aQ3UP38 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cracr2aQ3UP38 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cracr2aQ3UP38 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cracr2aQ3UP38 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cracr2aQ3UP38 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cracr2aQ3UP38 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cracr2aQ3UP38 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cracr2aQ3UP38 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cracr2aQ3UP38 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cracr2aQ3UP38 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cracr2aQ3UP38 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cracr2aQ3UP38 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cracr2aQ3UP38 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cracr2aQ3UP38 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cracr2aQ3UP38 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cracr2aQ3UP38 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cracr2aQ3UP38 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cracr2aQ3UP38 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cracr2aQ3UP38 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cracr2aQ3UP38 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cracr2aQ3UP38 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cracr2aQ3UP38 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cracr2aQ3UP38 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cracr2aQ3UP38 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cracr2aQ3UP38 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cracr2aQ3UP38 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cracr2aQ3UP38 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cracr2aQ3UP38 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cracr2aQ3UP38 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cracr2aQ3UP38 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cracr2aQ3UP38 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cracr2aQ3UP38 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cracr2aQ3UP38 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cracr2aQ3UP38 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cracr2aQ3UP38 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cracr2aQ3UP38 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cracr2aQ3UP38 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cracr2aQ3UP38 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cracr2aQ3UP38 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Cracr2aQ3UP38 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cracr2aQ3UP38 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cracr2aQ3UP38 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cracr2aQ3UP38 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cracr2aQ3UP38 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cracr2aQ3UP38 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cracr2aQ3UP38 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.3 ms