Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cobll1Q3UMF0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cobll1Q3UMF0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cobll1Q3UMF0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cobll1Q3UMF0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cobll1Q3UMF0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cobll1Q3UMF0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cobll1Q3UMF0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cobll1Q3UMF0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cobll1Q3UMF0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cobll1Q3UMF0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cobll1Q3UMF0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cobll1Q3UMF0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cobll1Q3UMF0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cobll1Q3UMF0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cobll1Q3UMF0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cobll1Q3UMF0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cobll1Q3UMF0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cobll1Q3UMF0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cobll1Q3UMF0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cobll1Q3UMF0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cobll1Q3UMF0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cobll1Q3UMF0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cobll1Q3UMF0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cobll1Q3UMF0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cobll1Q3UMF0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cobll1Q3UMF0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cobll1Q3UMF0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cobll1Q3UMF0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cobll1Q3UMF0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cobll1Q3UMF0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cobll1Q3UMF0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cobll1Q3UMF0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cobll1Q3UMF0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cobll1Q3UMF0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cobll1Q3UMF0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cobll1Q3UMF0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cobll1Q3UMF0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cobll1Q3UMF0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cobll1Q3UMF0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cobll1Q3UMF0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cobll1Q3UMF0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cobll1Q3UMF0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cobll1Q3UMF0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cobll1Q3UMF0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cobll1Q3UMF0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cobll1Q3UMF0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms