Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULJ3

Upf3a, MCG3697, isoform CRA_c, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf3aQ3ULJ3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Upf3aQ3ULJ3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Upf3aQ3ULJ3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Upf3aQ3ULJ3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Upf3aQ3ULJ3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Upf3aQ3ULJ3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Upf3aQ3ULJ3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Upf3aQ3ULJ3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Upf3aQ3ULJ3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Upf3aQ3ULJ3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Upf3aQ3ULJ3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Upf3aQ3ULJ3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Upf3aQ3ULJ3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Upf3aQ3ULJ3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Upf3aQ3ULJ3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Upf3aQ3ULJ3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Upf3aQ3ULJ3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Upf3aQ3ULJ3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upf3aQ3ULJ3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upf3aQ3ULJ3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upf3aQ3ULJ3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Upf3aQ3ULJ3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upf3aQ3ULJ3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upf3aQ3ULJ3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Upf3aQ3ULJ3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upf3aQ3ULJ3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Upf3aQ3ULJ3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upf3aQ3ULJ3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upf3aQ3ULJ3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upf3aQ3ULJ3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Upf3aQ3ULJ3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Upf3aQ3ULJ3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Upf3aQ3ULJ3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upf3aQ3ULJ3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upf3aQ3ULJ3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upf3aQ3ULJ3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upf3aQ3ULJ3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upf3aQ3ULJ3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upf3aQ3ULJ3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upf3aQ3ULJ3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upf3aQ3ULJ3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Upf3aQ3ULJ3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Upf3aQ3ULJ3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Upf3aQ3ULJ3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Upf3aQ3ULJ3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Upf3aQ3ULJ3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Upf3aQ3ULJ3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upf3aQ3ULJ3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upf3aQ3ULJ3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upf3aQ3ULJ3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upf3aQ3ULJ3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upf3aQ3ULJ3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upf3aQ3ULJ3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upf3aQ3ULJ3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upf3aQ3ULJ3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Upf3aQ3ULJ3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Upf3aQ3ULJ3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Upf3aQ3ULJ3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Upf3aQ3ULJ3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Upf3aQ3ULJ3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Upf3aQ3ULJ3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Upf3aQ3ULJ3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Upf3aQ3ULJ3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Upf3aQ3ULJ3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Upf3aQ3ULJ3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Upf3aQ3ULJ3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Upf3aQ3ULJ3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Upf3aQ3ULJ3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Upf3aQ3ULJ3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Upf3aQ3ULJ3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Upf3aQ3ULJ3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Upf3aQ3ULJ3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Upf3aQ3ULJ3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Upf3aQ3ULJ3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Upf3aQ3ULJ3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Upf3aQ3ULJ3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Upf3aQ3ULJ3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Upf3aQ3ULJ3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Upf3aQ3ULJ3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Upf3aQ3ULJ3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Upf3aQ3ULJ3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Upf3aQ3ULJ3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Upf3aQ3ULJ3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Upf3aQ3ULJ3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Upf3aQ3ULJ3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Upf3aQ3ULJ3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Upf3aQ3ULJ3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Upf3aQ3ULJ3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Upf3aQ3ULJ3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Upf3aQ3ULJ3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Upf3aQ3ULJ3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Upf3aQ3ULJ3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Upf3aQ3ULJ3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Upf3aQ3ULJ3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Upf3aQ3ULJ3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Upf3aQ3ULJ3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Upf3aQ3ULJ3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Upf3aQ3ULJ3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Upf3aQ3ULJ3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Upf3aQ3ULJ3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms