Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Usp19Q3UJD6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp19Q3UJD6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp19Q3UJD6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp19Q3UJD6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp19Q3UJD6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp19Q3UJD6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp19Q3UJD6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp19Q3UJD6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp19Q3UJD6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Usp19Q3UJD6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Usp19Q3UJD6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Usp19Q3UJD6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Usp19Q3UJD6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Usp19Q3UJD6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Usp19Q3UJD6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Usp19Q3UJD6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Usp19Q3UJD6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Usp19Q3UJD6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Usp19Q3UJD6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Usp19Q3UJD6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Usp19Q3UJD6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Usp19Q3UJD6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp19Q3UJD6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp19Q3UJD6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp19Q3UJD6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp19Q3UJD6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp19Q3UJD6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp19Q3UJD6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp19Q3UJD6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp19Q3UJD6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp19Q3UJD6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp19Q3UJD6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp19Q3UJD6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp19Q3UJD6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Usp19Q3UJD6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Usp19Q3UJD6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Usp19Q3UJD6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Usp19Q3UJD6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Usp19Q3UJD6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Usp19Q3UJD6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp19Q3UJD6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp19Q3UJD6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp19Q3UJD6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp19Q3UJD6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp19Q3UJD6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp19Q3UJD6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Usp19Q3UJD6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Usp19Q3UJD6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Usp19Q3UJD6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Usp19Q3UJD6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Usp19Q3UJD6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Usp19Q3UJD6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Usp19Q3UJD6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Usp19Q3UJD6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Usp19Q3UJD6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Usp19Q3UJD6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Usp19Q3UJD6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Usp19Q3UJD6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Usp19Q3UJD6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp19Q3UJD6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp19Q3UJD6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp19Q3UJD6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp19Q3UJD6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp19Q3UJD6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp19Q3UJD6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp19Q3UJD6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp19Q3UJD6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Usp19Q3UJD6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Usp19Q3UJD6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Usp19Q3UJD6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Usp19Q3UJD6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Usp19Q3UJD6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Usp19Q3UJD6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Usp19Q3UJD6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Usp19Q3UJD6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Usp19Q3UJD6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp19Q3UJD6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp19Q3UJD6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp19Q3UJD6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp19Q3UJD6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp19Q3UJD6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp19Q3UJD6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp19Q3UJD6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp19Q3UJD6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Usp19Q3UJD6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Usp19Q3UJD6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Usp19Q3UJD6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Usp19Q3UJD6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Usp19Q3UJD6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Usp19Q3UJD6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Usp19Q3UJD6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Usp19Q3UJD6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Usp19Q3UJD6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Usp19Q3UJD6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Usp19Q3UJD6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Usp19Q3UJD6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Usp19Q3UJD6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Usp19Q3UJD6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Usp19Q3UJD6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms