Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trafd1Q3UDK1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trafd1Q3UDK1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trafd1Q3UDK1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trafd1Q3UDK1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trafd1Q3UDK1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trafd1Q3UDK1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trafd1Q3UDK1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trafd1Q3UDK1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trafd1Q3UDK1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trafd1Q3UDK1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trafd1Q3UDK1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trafd1Q3UDK1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trafd1Q3UDK1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trafd1Q3UDK1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trafd1Q3UDK1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trafd1Q3UDK1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trafd1Q3UDK1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trafd1Q3UDK1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trafd1Q3UDK1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trafd1Q3UDK1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trafd1Q3UDK1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trafd1Q3UDK1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trafd1Q3UDK1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trafd1Q3UDK1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trafd1Q3UDK1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trafd1Q3UDK1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trafd1Q3UDK1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trafd1Q3UDK1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trafd1Q3UDK1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trafd1Q3UDK1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trafd1Q3UDK1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trafd1Q3UDK1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trafd1Q3UDK1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trafd1Q3UDK1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trafd1Q3UDK1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trafd1Q3UDK1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trafd1Q3UDK1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trafd1Q3UDK1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trafd1Q3UDK1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Trafd1Q3UDK1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trafd1Q3UDK1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trafd1Q3UDK1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trafd1Q3UDK1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trafd1Q3UDK1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trafd1Q3UDK1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trafd1Q3UDK1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trafd1Q3UDK1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trafd1Q3UDK1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trafd1Q3UDK1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trafd1Q3UDK1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trafd1Q3UDK1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trafd1Q3UDK1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trafd1Q3UDK1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trafd1Q3UDK1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trafd1Q3UDK1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trafd1Q3UDK1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trafd1Q3UDK1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trafd1Q3UDK1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trafd1Q3UDK1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trafd1Q3UDK1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trafd1Q3UDK1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trafd1Q3UDK1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trafd1Q3UDK1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trafd1Q3UDK1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trafd1Q3UDK1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trafd1Q3UDK1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trafd1Q3UDK1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trafd1Q3UDK1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trafd1Q3UDK1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trafd1Q3UDK1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trafd1Q3UDK1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trafd1Q3UDK1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trafd1Q3UDK1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trafd1Q3UDK1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trafd1Q3UDK1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trafd1Q3UDK1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trafd1Q3UDK1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trafd1Q3UDK1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trafd1Q3UDK1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trafd1Q3UDK1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trafd1Q3UDK1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trafd1Q3UDK1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trafd1Q3UDK1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trafd1Q3UDK1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trafd1Q3UDK1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trafd1Q3UDK1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trafd1Q3UDK1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trafd1Q3UDK1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trafd1Q3UDK1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trafd1Q3UDK1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trafd1Q3UDK1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trafd1Q3UDK1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trafd1Q3UDK1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trafd1Q3UDK1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trafd1Q3UDK1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trafd1Q3UDK1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trafd1Q3UDK1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trafd1Q3UDK1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trafd1Q3UDK1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms