Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pid1Q3UBG2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pid1Q3UBG2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pid1Q3UBG2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pid1Q3UBG2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pid1Q3UBG2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pid1Q3UBG2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pid1Q3UBG2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pid1Q3UBG2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pid1Q3UBG2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pid1Q3UBG2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pid1Q3UBG2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pid1Q3UBG2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pid1Q3UBG2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pid1Q3UBG2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pid1Q3UBG2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pid1Q3UBG2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pid1Q3UBG2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pid1Q3UBG2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pid1Q3UBG2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pid1Q3UBG2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pid1Q3UBG2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pid1Q3UBG2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pid1Q3UBG2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pid1Q3UBG2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pid1Q3UBG2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pid1Q3UBG2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pid1Q3UBG2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pid1Q3UBG2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pid1Q3UBG2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pid1Q3UBG2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pid1Q3UBG2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pid1Q3UBG2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pid1Q3UBG2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pid1Q3UBG2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pid1Q3UBG2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pid1Q3UBG2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pid1Q3UBG2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pid1Q3UBG2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pid1Q3UBG2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pid1Q3UBG2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pid1Q3UBG2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pid1Q3UBG2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pid1Q3UBG2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pid1Q3UBG2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pid1Q3UBG2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pid1Q3UBG2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pid1Q3UBG2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pid1Q3UBG2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pid1Q3UBG2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pid1Q3UBG2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pid1Q3UBG2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pid1Q3UBG2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pid1Q3UBG2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pid1Q3UBG2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pid1Q3UBG2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pid1Q3UBG2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pid1Q3UBG2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pid1Q3UBG2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pid1Q3UBG2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pid1Q3UBG2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pid1Q3UBG2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pid1Q3UBG2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pid1Q3UBG2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pid1Q3UBG2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pid1Q3UBG2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pid1Q3UBG2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pid1Q3UBG2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pid1Q3UBG2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pid1Q3UBG2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pid1Q3UBG2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pid1Q3UBG2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pid1Q3UBG2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pid1Q3UBG2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pid1Q3UBG2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pid1Q3UBG2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pid1Q3UBG2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pid1Q3UBG2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pid1Q3UBG2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pid1Q3UBG2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pid1Q3UBG2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pid1Q3UBG2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pid1Q3UBG2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pid1Q3UBG2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pid1Q3UBG2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pid1Q3UBG2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pid1Q3UBG2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pid1Q3UBG2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pid1Q3UBG2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pid1Q3UBG2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pid1Q3UBG2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pid1Q3UBG2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pid1Q3UBG2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pid1Q3UBG2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pid1Q3UBG2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pid1Q3UBG2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pid1Q3UBG2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pid1Q3UBG2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pid1Q3UBG2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pid1Q3UBG2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms