Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trip13Q3UA06 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trip13Q3UA06 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trip13Q3UA06 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trip13Q3UA06 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trip13Q3UA06 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trip13Q3UA06 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trip13Q3UA06 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trip13Q3UA06 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trip13Q3UA06 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trip13Q3UA06 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trip13Q3UA06 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trip13Q3UA06 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trip13Q3UA06 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trip13Q3UA06 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trip13Q3UA06 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trip13Q3UA06 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trip13Q3UA06 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trip13Q3UA06 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trip13Q3UA06 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trip13Q3UA06 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Trip13Q3UA06 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trip13Q3UA06 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trip13Q3UA06 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trip13Q3UA06 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trip13Q3UA06 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trip13Q3UA06 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trip13Q3UA06 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trip13Q3UA06 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trip13Q3UA06 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trip13Q3UA06 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trip13Q3UA06 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trip13Q3UA06 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trip13Q3UA06 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trip13Q3UA06 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trip13Q3UA06 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trip13Q3UA06 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trip13Q3UA06 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trip13Q3UA06 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trip13Q3UA06 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trip13Q3UA06 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trip13Q3UA06 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trip13Q3UA06 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trip13Q3UA06 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trip13Q3UA06 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trip13Q3UA06 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Trip13Q3UA06 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trip13Q3UA06 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trip13Q3UA06 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trip13Q3UA06 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trip13Q3UA06 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trip13Q3UA06 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trip13Q3UA06 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trip13Q3UA06 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trip13Q3UA06 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trip13Q3UA06 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trip13Q3UA06 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trip13Q3UA06 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trip13Q3UA06 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trip13Q3UA06 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trip13Q3UA06 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trip13Q3UA06 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trip13Q3UA06 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trip13Q3UA06 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trip13Q3UA06 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trip13Q3UA06 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trip13Q3UA06 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trip13Q3UA06 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trip13Q3UA06 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trip13Q3UA06 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trip13Q3UA06 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trip13Q3UA06 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trip13Q3UA06 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trip13Q3UA06 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trip13Q3UA06 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trip13Q3UA06 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trip13Q3UA06 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trip13Q3UA06 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trip13Q3UA06 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trip13Q3UA06 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trip13Q3UA06 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trip13Q3UA06 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trip13Q3UA06 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trip13Q3UA06 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trip13Q3UA06 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trip13Q3UA06 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trip13Q3UA06 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trip13Q3UA06 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trip13Q3UA06 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trip13Q3UA06 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trip13Q3UA06 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trip13Q3UA06 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trip13Q3UA06 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trip13Q3UA06 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trip13Q3UA06 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trip13Q3UA06 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms