Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Serac1Q3U213 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Serac1Q3U213 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Serac1Q3U213 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Serac1Q3U213 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Serac1Q3U213 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Serac1Q3U213 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Serac1Q3U213 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Serac1Q3U213 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Serac1Q3U213 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Serac1Q3U213 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Serac1Q3U213 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Serac1Q3U213 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Serac1Q3U213 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Serac1Q3U213 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Serac1Q3U213 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Serac1Q3U213 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Serac1Q3U213 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Serac1Q3U213 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Serac1Q3U213 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Serac1Q3U213 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Serac1Q3U213 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Serac1Q3U213 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Serac1Q3U213 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Serac1Q3U213 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Serac1Q3U213 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Serac1Q3U213 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Serac1Q3U213 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Serac1Q3U213 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Serac1Q3U213 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Serac1Q3U213 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Serac1Q3U213 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Serac1Q3U213 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Serac1Q3U213 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Serac1Q3U213 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Serac1Q3U213 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Serac1Q3U213 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Serac1Q3U213 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Serac1Q3U213 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Serac1Q3U213 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Serac1Q3U213 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Serac1Q3U213 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Serac1Q3U213 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Serac1Q3U213 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Serac1Q3U213 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Serac1Q3U213 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Serac1Q3U213 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Serac1Q3U213 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Serac1Q3U213 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Serac1Q3U213 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Serac1Q3U213 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Serac1Q3U213 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Serac1Q3U213 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Serac1Q3U213 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Serac1Q3U213 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Serac1Q3U213 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Serac1Q3U213 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Serac1Q3U213 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Serac1Q3U213 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Serac1Q3U213 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Serac1Q3U213 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Serac1Q3U213 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Serac1Q3U213 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Serac1Q3U213 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Serac1Q3U213 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Serac1Q3U213 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Serac1Q3U213 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Serac1Q3U213 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Serac1Q3U213 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Serac1Q3U213 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Serac1Q3U213 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Serac1Q3U213 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Serac1Q3U213 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Serac1Q3U213 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Serac1Q3U213 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Serac1Q3U213 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Serac1Q3U213 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Serac1Q3U213 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Serac1Q3U213 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Serac1Q3U213 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Serac1Q3U213 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Serac1Q3U213 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Serac1Q3U213 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Serac1Q3U213 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Serac1Q3U213 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Serac1Q3U213 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Serac1Q3U213 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Serac1Q3U213 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Serac1Q3U213 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Serac1Q3U213 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Serac1Q3U213 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Serac1Q3U213 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Serac1Q3U213 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Serac1Q3U213 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Serac1Q3U213 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Serac1Q3U213 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Serac1Q3U213 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Serac1Q3U213 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Serac1Q3U213 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Serac1Q3U213 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms