Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc174Q3U155 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc174Q3U155 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc174Q3U155 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc174Q3U155 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc174Q3U155 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc174Q3U155 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc174Q3U155 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc174Q3U155 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc174Q3U155 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc174Q3U155 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc174Q3U155 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc174Q3U155 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc174Q3U155 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc174Q3U155 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc174Q3U155 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc174Q3U155 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc174Q3U155 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc174Q3U155 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc174Q3U155 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc174Q3U155 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc174Q3U155 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc174Q3U155 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc174Q3U155 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc174Q3U155 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc174Q3U155 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc174Q3U155 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc174Q3U155 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc174Q3U155 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc174Q3U155 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc174Q3U155 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc174Q3U155 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc174Q3U155 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc174Q3U155 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc174Q3U155 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc174Q3U155 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc174Q3U155 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc174Q3U155 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc174Q3U155 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ccdc174Q3U155 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ccdc174Q3U155 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc174Q3U155 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc174Q3U155 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc174Q3U155 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc174Q3U155 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc174Q3U155 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc174Q3U155 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc174Q3U155 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc174Q3U155 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc174Q3U155 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc174Q3U155 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc174Q3U155 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc174Q3U155 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc174Q3U155 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc174Q3U155 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc174Q3U155 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc174Q3U155 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc174Q3U155 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc174Q3U155 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc174Q3U155 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc174Q3U155 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc174Q3U155 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc174Q3U155 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc174Q3U155 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc174Q3U155 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc174Q3U155 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc174Q3U155 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc174Q3U155 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc174Q3U155 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc174Q3U155 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc174Q3U155 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc174Q3U155 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc174Q3U155 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc174Q3U155 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc174Q3U155 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc174Q3U155 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc174Q3U155 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc174Q3U155 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc174Q3U155 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc174Q3U155 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc174Q3U155 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc174Q3U155 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc174Q3U155 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc174Q3U155 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc174Q3U155 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc174Q3U155 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc174Q3U155 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc174Q3U155 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc174Q3U155 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc174Q3U155 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc174Q3U155 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc174Q3U155 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc174Q3U155 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc174Q3U155 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc174Q3U155 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc174Q3U155 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc174Q3U155 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc174Q3U155 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc174Q3U155 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc174Q3U155 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms