Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem35bQ3U0Y2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tmem35bQ3U0Y2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tmem35bQ3U0Y2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem35bQ3U0Y2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem35bQ3U0Y2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem35bQ3U0Y2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem35bQ3U0Y2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem35bQ3U0Y2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem35bQ3U0Y2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem35bQ3U0Y2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem35bQ3U0Y2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem35bQ3U0Y2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem35bQ3U0Y2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem35bQ3U0Y2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem35bQ3U0Y2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem35bQ3U0Y2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem35bQ3U0Y2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem35bQ3U0Y2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem35bQ3U0Y2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem35bQ3U0Y2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem35bQ3U0Y2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem35bQ3U0Y2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem35bQ3U0Y2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem35bQ3U0Y2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem35bQ3U0Y2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmem35bQ3U0Y2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmem35bQ3U0Y2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem35bQ3U0Y2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem35bQ3U0Y2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem35bQ3U0Y2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem35bQ3U0Y2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem35bQ3U0Y2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem35bQ3U0Y2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem35bQ3U0Y2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem35bQ3U0Y2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem35bQ3U0Y2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem35bQ3U0Y2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem35bQ3U0Y2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem35bQ3U0Y2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem35bQ3U0Y2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem35bQ3U0Y2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem35bQ3U0Y2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem35bQ3U0Y2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem35bQ3U0Y2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem35bQ3U0Y2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem35bQ3U0Y2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem35bQ3U0Y2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem35bQ3U0Y2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem35bQ3U0Y2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem35bQ3U0Y2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem35bQ3U0Y2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem35bQ3U0Y2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem35bQ3U0Y2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem35bQ3U0Y2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem35bQ3U0Y2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem35bQ3U0Y2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem35bQ3U0Y2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem35bQ3U0Y2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem35bQ3U0Y2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem35bQ3U0Y2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem35bQ3U0Y2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem35bQ3U0Y2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tmem35bQ3U0Y2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem35bQ3U0Y2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem35bQ3U0Y2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem35bQ3U0Y2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem35bQ3U0Y2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem35bQ3U0Y2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem35bQ3U0Y2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem35bQ3U0Y2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem35bQ3U0Y2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem35bQ3U0Y2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem35bQ3U0Y2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem35bQ3U0Y2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem35bQ3U0Y2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem35bQ3U0Y2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem35bQ3U0Y2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem35bQ3U0Y2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem35bQ3U0Y2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem35bQ3U0Y2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem35bQ3U0Y2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem35bQ3U0Y2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem35bQ3U0Y2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem35bQ3U0Y2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem35bQ3U0Y2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem35bQ3U0Y2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem35bQ3U0Y2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem35bQ3U0Y2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem35bQ3U0Y2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem35bQ3U0Y2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem35bQ3U0Y2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
Tmem35bQ3U0Y2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem35bQ3U0Y2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem35bQ3U0Y2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem35bQ3U0Y2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms