Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Palb2Q3U0P1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Palb2Q3U0P1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Palb2Q3U0P1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Palb2Q3U0P1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Palb2Q3U0P1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Palb2Q3U0P1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Palb2Q3U0P1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Palb2Q3U0P1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Palb2Q3U0P1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Palb2Q3U0P1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Palb2Q3U0P1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Palb2Q3U0P1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Palb2Q3U0P1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Palb2Q3U0P1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Palb2Q3U0P1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Palb2Q3U0P1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Palb2Q3U0P1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Palb2Q3U0P1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Palb2Q3U0P1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Palb2Q3U0P1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Palb2Q3U0P1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Palb2Q3U0P1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Palb2Q3U0P1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Palb2Q3U0P1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Palb2Q3U0P1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Palb2Q3U0P1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Palb2Q3U0P1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Palb2Q3U0P1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Palb2Q3U0P1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Palb2Q3U0P1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Palb2Q3U0P1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Palb2Q3U0P1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Palb2Q3U0P1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Palb2Q3U0P1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Palb2Q3U0P1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Palb2Q3U0P1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Palb2Q3U0P1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Palb2Q3U0P1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Palb2Q3U0P1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Palb2Q3U0P1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Palb2Q3U0P1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Palb2Q3U0P1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Palb2Q3U0P1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Palb2Q3U0P1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Palb2Q3U0P1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Palb2Q3U0P1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Palb2Q3U0P1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Palb2Q3U0P1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Palb2Q3U0P1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Palb2Q3U0P1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Palb2Q3U0P1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Palb2Q3U0P1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Palb2Q3U0P1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Palb2Q3U0P1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Palb2Q3U0P1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Palb2Q3U0P1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Palb2Q3U0P1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Palb2Q3U0P1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Palb2Q3U0P1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Palb2Q3U0P1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Palb2Q3U0P1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Palb2Q3U0P1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Palb2Q3U0P1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Palb2Q3U0P1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Palb2Q3U0P1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Palb2Q3U0P1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Palb2Q3U0P1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Palb2Q3U0P1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Palb2Q3U0P1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Palb2Q3U0P1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Palb2Q3U0P1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Palb2Q3U0P1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Palb2Q3U0P1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Palb2Q3U0P1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Palb2Q3U0P1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Palb2Q3U0P1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Palb2Q3U0P1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Palb2Q3U0P1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Palb2Q3U0P1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Palb2Q3U0P1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Palb2Q3U0P1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Palb2Q3U0P1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Palb2Q3U0P1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Palb2Q3U0P1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Palb2Q3U0P1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Palb2Q3U0P1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Palb2Q3U0P1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Palb2Q3U0P1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Palb2Q3U0P1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Palb2Q3U0P1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Palb2Q3U0P1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Palb2Q3U0P1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Palb2Q3U0P1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Palb2Q3U0P1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Palb2Q3U0P1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Palb2Q3U0P1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Palb2Q3U0P1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Palb2Q3U0P1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Palb2Q3U0P1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms