Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tbc1d2bQ3U0J8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tbc1d2bQ3U0J8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tbc1d2bQ3U0J8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tbc1d2bQ3U0J8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tbc1d2bQ3U0J8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tbc1d2bQ3U0J8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Tbc1d2bQ3U0J8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tbc1d2bQ3U0J8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tbc1d2bQ3U0J8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tbc1d2bQ3U0J8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tbc1d2bQ3U0J8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tbc1d2bQ3U0J8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tbc1d2bQ3U0J8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tbc1d2bQ3U0J8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tbc1d2bQ3U0J8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tbc1d2bQ3U0J8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Tbc1d2bQ3U0J8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Tbc1d2bQ3U0J8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tbc1d2bQ3U0J8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tbc1d2bQ3U0J8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tbc1d2bQ3U0J8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Tbc1d2bQ3U0J8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tbc1d2bQ3U0J8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Tbc1d2bQ3U0J8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tbc1d2bQ3U0J8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tbc1d2bQ3U0J8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tbc1d2bQ3U0J8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Tbc1d2bQ3U0J8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tbc1d2bQ3U0J8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tbc1d2bQ3U0J8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tbc1d2bQ3U0J8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tbc1d2bQ3U0J8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tbc1d2bQ3U0J8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tbc1d2bQ3U0J8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tbc1d2bQ3U0J8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tbc1d2bQ3U0J8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tbc1d2bQ3U0J8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Tbc1d2bQ3U0J8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tbc1d2bQ3U0J8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tbc1d2bQ3U0J8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tbc1d2bQ3U0J8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tbc1d2bQ3U0J8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tbc1d2bQ3U0J8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tbc1d2bQ3U0J8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tbc1d2bQ3U0J8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Tbc1d2bQ3U0J8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tbc1d2bQ3U0J8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tbc1d2bQ3U0J8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tbc1d2bQ3U0J8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tbc1d2bQ3U0J8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tbc1d2bQ3U0J8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tbc1d2bQ3U0J8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms