Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hace1Q3U0D9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hace1Q3U0D9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hace1Q3U0D9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hace1Q3U0D9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hace1Q3U0D9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hace1Q3U0D9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hace1Q3U0D9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hace1Q3U0D9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hace1Q3U0D9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hace1Q3U0D9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hace1Q3U0D9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hace1Q3U0D9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hace1Q3U0D9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hace1Q3U0D9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hace1Q3U0D9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hace1Q3U0D9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hace1Q3U0D9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hace1Q3U0D9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hace1Q3U0D9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hace1Q3U0D9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hace1Q3U0D9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hace1Q3U0D9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hace1Q3U0D9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hace1Q3U0D9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hace1Q3U0D9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Hace1Q3U0D9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hace1Q3U0D9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hace1Q3U0D9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hace1Q3U0D9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hace1Q3U0D9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hace1Q3U0D9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hace1Q3U0D9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hace1Q3U0D9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hace1Q3U0D9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hace1Q3U0D9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hace1Q3U0D9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hace1Q3U0D9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hace1Q3U0D9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Hace1Q3U0D9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hace1Q3U0D9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hace1Q3U0D9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hace1Q3U0D9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hace1Q3U0D9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hace1Q3U0D9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hace1Q3U0D9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hace1Q3U0D9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hace1Q3U0D9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hace1Q3U0D9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hace1Q3U0D9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hace1Q3U0D9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hace1Q3U0D9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hace1Q3U0D9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hace1Q3U0D9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hace1Q3U0D9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hace1Q3U0D9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hace1Q3U0D9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hace1Q3U0D9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Hace1Q3U0D9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hace1Q3U0D9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hace1Q3U0D9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hace1Q3U0D9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hace1Q3U0D9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hace1Q3U0D9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hace1Q3U0D9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hace1Q3U0D9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hace1Q3U0D9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hace1Q3U0D9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hace1Q3U0D9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hace1Q3U0D9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hace1Q3U0D9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hace1Q3U0D9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hace1Q3U0D9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hace1Q3U0D9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hace1Q3U0D9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hace1Q3U0D9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hace1Q3U0D9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hace1Q3U0D9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Hace1Q3U0D9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hace1Q3U0D9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hace1Q3U0D9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hace1Q3U0D9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hace1Q3U0D9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hace1Q3U0D9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hace1Q3U0D9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hace1Q3U0D9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hace1Q3U0D9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hace1Q3U0D9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hace1Q3U0D9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hace1Q3U0D9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hace1Q3U0D9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hace1Q3U0D9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hace1Q3U0D9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hace1Q3U0D9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hace1Q3U0D9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hace1Q3U0D9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hace1Q3U0D9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hace1Q3U0D9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hace1Q3U0D9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hace1Q3U0D9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.3 ms