Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYU2

Atp13a5, Probable cation-transporting ATPase 13A5, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a5Q3TYU2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp13a5Q3TYU2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp13a5Q3TYU2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp13a5Q3TYU2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp13a5Q3TYU2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp13a5Q3TYU2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp13a5Q3TYU2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp13a5Q3TYU2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp13a5Q3TYU2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp13a5Q3TYU2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp13a5Q3TYU2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp13a5Q3TYU2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp13a5Q3TYU2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp13a5Q3TYU2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp13a5Q3TYU2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp13a5Q3TYU2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp13a5Q3TYU2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp13a5Q3TYU2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp13a5Q3TYU2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp13a5Q3TYU2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp13a5Q3TYU2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp13a5Q3TYU2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp13a5Q3TYU2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp13a5Q3TYU2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp13a5Q3TYU2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp13a5Q3TYU2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp13a5Q3TYU2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp13a5Q3TYU2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp13a5Q3TYU2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp13a5Q3TYU2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp13a5Q3TYU2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp13a5Q3TYU2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp13a5Q3TYU2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp13a5Q3TYU2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp13a5Q3TYU2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp13a5Q3TYU2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp13a5Q3TYU2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp13a5Q3TYU2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp13a5Q3TYU2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp13a5Q3TYU2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp13a5Q3TYU2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp13a5Q3TYU2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp13a5Q3TYU2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp13a5Q3TYU2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp13a5Q3TYU2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp13a5Q3TYU2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp13a5Q3TYU2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp13a5Q3TYU2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp13a5Q3TYU2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp13a5Q3TYU2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp13a5Q3TYU2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp13a5Q3TYU2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp13a5Q3TYU2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp13a5Q3TYU2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp13a5Q3TYU2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp13a5Q3TYU2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp13a5Q3TYU2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp13a5Q3TYU2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp13a5Q3TYU2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp13a5Q3TYU2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp13a5Q3TYU2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp13a5Q3TYU2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp13a5Q3TYU2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp13a5Q3TYU2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp13a5Q3TYU2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp13a5Q3TYU2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a5Q3TYU2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a5Q3TYU2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a5Q3TYU2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a5Q3TYU2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a5Q3TYU2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a5Q3TYU2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp13a5Q3TYU2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp13a5Q3TYU2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp13a5Q3TYU2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp13a5Q3TYU2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp13a5Q3TYU2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp13a5Q3TYU2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp13a5Q3TYU2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp13a5Q3TYU2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp13a5Q3TYU2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp13a5Q3TYU2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp13a5Q3TYU2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp13a5Q3TYU2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp13a5Q3TYU2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp13a5Q3TYU2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp13a5Q3TYU2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp13a5Q3TYU2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp13a5Q3TYU2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp13a5Q3TYU2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp13a5Q3TYU2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp13a5Q3TYU2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp13a5Q3TYU2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp13a5Q3TYU2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp13a5Q3TYU2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp13a5Q3TYU2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp13a5Q3TYU2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Atp13a5Q3TYU2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp13a5Q3TYU2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp13a5Q3TYU2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms