Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrc28Q3TX51 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrc28Q3TX51 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lrrc28Q3TX51 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc28Q3TX51 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc28Q3TX51 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc28Q3TX51 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc28Q3TX51 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc28Q3TX51 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc28Q3TX51 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc28Q3TX51 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc28Q3TX51 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc28Q3TX51 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc28Q3TX51 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrc28Q3TX51 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrc28Q3TX51 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrc28Q3TX51 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrc28Q3TX51 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrc28Q3TX51 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrc28Q3TX51 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrc28Q3TX51 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrc28Q3TX51 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrc28Q3TX51 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc28Q3TX51 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc28Q3TX51 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc28Q3TX51 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc28Q3TX51 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc28Q3TX51 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc28Q3TX51 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc28Q3TX51 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc28Q3TX51 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc28Q3TX51 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc28Q3TX51 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc28Q3TX51 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc28Q3TX51 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc28Q3TX51 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc28Q3TX51 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc28Q3TX51 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc28Q3TX51 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc28Q3TX51 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc28Q3TX51 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc28Q3TX51 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc28Q3TX51 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc28Q3TX51 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc28Q3TX51 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc28Q3TX51 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc28Q3TX51 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc28Q3TX51 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc28Q3TX51 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc28Q3TX51 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc28Q3TX51 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrc28Q3TX51 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrc28Q3TX51 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrc28Q3TX51 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrc28Q3TX51 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrc28Q3TX51 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc28Q3TX51 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc28Q3TX51 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc28Q3TX51 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc28Q3TX51 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc28Q3TX51 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc28Q3TX51 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc28Q3TX51 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc28Q3TX51 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc28Q3TX51 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc28Q3TX51 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc28Q3TX51 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc28Q3TX51 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc28Q3TX51 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc28Q3TX51 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc28Q3TX51 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc28Q3TX51 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc28Q3TX51 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc28Q3TX51 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc28Q3TX51 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc28Q3TX51 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc28Q3TX51 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc28Q3TX51 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc28Q3TX51 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc28Q3TX51 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc28Q3TX51 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc28Q3TX51 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc28Q3TX51 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc28Q3TX51 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc28Q3TX51 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc28Q3TX51 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lrrc28Q3TX51 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc28Q3TX51 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc28Q3TX51 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc28Q3TX51 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc28Q3TX51 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc28Q3TX51 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc28Q3TX51 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc28Q3TX51 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc28Q3TX51 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc28Q3TX51 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc28Q3TX51 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc28Q3TX51 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc28Q3TX51 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc28Q3TX51 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms