Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21440Q3TTD8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21440Q3TTD8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21440Q3TTD8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21440Q3TTD8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21440Q3TTD8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21440Q3TTD8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21440Q3TTD8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21440Q3TTD8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21440Q3TTD8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21440Q3TTD8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21440Q3TTD8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21440Q3TTD8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21440Q3TTD8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21440Q3TTD8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21440Q3TTD8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21440Q3TTD8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21440Q3TTD8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21440Q3TTD8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21440Q3TTD8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21440Q3TTD8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21440Q3TTD8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21440Q3TTD8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21440Q3TTD8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21440Q3TTD8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21440Q3TTD8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21440Q3TTD8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21440Q3TTD8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21440Q3TTD8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21440Q3TTD8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21440Q3TTD8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21440Q3TTD8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21440Q3TTD8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21440Q3TTD8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21440Q3TTD8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21440Q3TTD8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21440Q3TTD8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21440Q3TTD8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21440Q3TTD8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21440Q3TTD8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21440Q3TTD8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21440Q3TTD8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21440Q3TTD8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21440Q3TTD8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21440Q3TTD8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm21440Q3TTD8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21440Q3TTD8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21440Q3TTD8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21440Q3TTD8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21440Q3TTD8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21440Q3TTD8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21440Q3TTD8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21440Q3TTD8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21440Q3TTD8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21440Q3TTD8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21440Q3TTD8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21440Q3TTD8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm21440Q3TTD8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm21440Q3TTD8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm21440Q3TTD8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm21440Q3TTD8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm21440Q3TTD8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm21440Q3TTD8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm21440Q3TTD8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21440Q3TTD8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21440Q3TTD8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21440Q3TTD8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21440Q3TTD8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21440Q3TTD8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21440Q3TTD8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm21440Q3TTD8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm21440Q3TTD8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm21440Q3TTD8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm21440Q3TTD8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm21440Q3TTD8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm21440Q3TTD8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm21440Q3TTD8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm21440Q3TTD8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm21440Q3TTD8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm21440Q3TTD8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm21440Q3TTD8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm21440Q3TTD8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm21440Q3TTD8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm21440Q3TTD8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm21440Q3TTD8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm21440Q3TTD8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21440Q3TTD8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21440Q3TTD8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21440Q3TTD8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21440Q3TTD8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21440Q3TTD8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21440Q3TTD8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21440Q3TTD8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21440Q3TTD8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm21440Q3TTD8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21440Q3TTD8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21440Q3TTD8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21440Q3TTD8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21440Q3TTD8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm21440Q3TTD8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms