Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD49

Sppl2b, Signal peptide peptidase-like 2B, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl2bQ3TD49 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sppl2bQ3TD49 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sppl2bQ3TD49 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sppl2bQ3TD49 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sppl2bQ3TD49 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sppl2bQ3TD49 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sppl2bQ3TD49 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sppl2bQ3TD49 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sppl2bQ3TD49 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sppl2bQ3TD49 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sppl2bQ3TD49 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sppl2bQ3TD49 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Sppl2bQ3TD49 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sppl2bQ3TD49 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sppl2bQ3TD49 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sppl2bQ3TD49 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sppl2bQ3TD49 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sppl2bQ3TD49 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sppl2bQ3TD49 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sppl2bQ3TD49 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sppl2bQ3TD49 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sppl2bQ3TD49 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sppl2bQ3TD49 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sppl2bQ3TD49 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sppl2bQ3TD49 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sppl2bQ3TD49 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sppl2bQ3TD49 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sppl2bQ3TD49 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sppl2bQ3TD49 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sppl2bQ3TD49 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sppl2bQ3TD49 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sppl2bQ3TD49 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sppl2bQ3TD49 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sppl2bQ3TD49 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sppl2bQ3TD49 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sppl2bQ3TD49 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sppl2bQ3TD49 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sppl2bQ3TD49 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sppl2bQ3TD49 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sppl2bQ3TD49 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sppl2bQ3TD49 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sppl2bQ3TD49 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sppl2bQ3TD49 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sppl2bQ3TD49 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sppl2bQ3TD49 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sppl2bQ3TD49 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sppl2bQ3TD49 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sppl2bQ3TD49 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sppl2bQ3TD49 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sppl2bQ3TD49 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sppl2bQ3TD49 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sppl2bQ3TD49 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Sppl2bQ3TD49 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sppl2bQ3TD49 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sppl2bQ3TD49 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Sppl2bQ3TD49 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sppl2bQ3TD49 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sppl2bQ3TD49 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sppl2bQ3TD49 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sppl2bQ3TD49 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sppl2bQ3TD49 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sppl2bQ3TD49 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sppl2bQ3TD49 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sppl2bQ3TD49 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sppl2bQ3TD49 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sppl2bQ3TD49 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sppl2bQ3TD49 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sppl2bQ3TD49 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sppl2bQ3TD49 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sppl2bQ3TD49 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sppl2bQ3TD49 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sppl2bQ3TD49 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sppl2bQ3TD49 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sppl2bQ3TD49 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sppl2bQ3TD49 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sppl2bQ3TD49 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sppl2bQ3TD49 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sppl2bQ3TD49 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sppl2bQ3TD49 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sppl2bQ3TD49 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sppl2bQ3TD49 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Sppl2bQ3TD49 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sppl2bQ3TD49 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sppl2bQ3TD49 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sppl2bQ3TD49 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sppl2bQ3TD49 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sppl2bQ3TD49 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sppl2bQ3TD49 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sppl2bQ3TD49 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sppl2bQ3TD49 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sppl2bQ3TD49 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sppl2bQ3TD49 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sppl2bQ3TD49 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sppl2bQ3TD49 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sppl2bQ3TD49 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sppl2bQ3TD49 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sppl2bQ3TD49 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sppl2bQ3TD49 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sppl2bQ3TD49 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sppl2bQ3TD49 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms