Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBL6

Tnfaip8l3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l3Q3TBL6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnfaip8l3Q3TBL6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnfaip8l3Q3TBL6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnfaip8l3Q3TBL6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnfaip8l3Q3TBL6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tnfaip8l3Q3TBL6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnfaip8l3Q3TBL6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnfaip8l3Q3TBL6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnfaip8l3Q3TBL6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnfaip8l3Q3TBL6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnfaip8l3Q3TBL6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnfaip8l3Q3TBL6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnfaip8l3Q3TBL6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfaip8l3Q3TBL6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfaip8l3Q3TBL6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfaip8l3Q3TBL6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfaip8l3Q3TBL6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnfaip8l3Q3TBL6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnfaip8l3Q3TBL6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnfaip8l3Q3TBL6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnfaip8l3Q3TBL6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnfaip8l3Q3TBL6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnfaip8l3Q3TBL6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnfaip8l3Q3TBL6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnfaip8l3Q3TBL6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnfaip8l3Q3TBL6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnfaip8l3Q3TBL6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnfaip8l3Q3TBL6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnfaip8l3Q3TBL6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnfaip8l3Q3TBL6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnfaip8l3Q3TBL6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnfaip8l3Q3TBL6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnfaip8l3Q3TBL6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnfaip8l3Q3TBL6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnfaip8l3Q3TBL6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.8 ms