Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXB8

Colec11, Collectin-11, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec11Q3SXB8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Colec11Q3SXB8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Colec11Q3SXB8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Colec11Q3SXB8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Colec11Q3SXB8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Colec11Q3SXB8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Colec11Q3SXB8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Colec11Q3SXB8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Colec11Q3SXB8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Colec11Q3SXB8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Colec11Q3SXB8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Colec11Q3SXB8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Colec11Q3SXB8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Colec11Q3SXB8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Colec11Q3SXB8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Colec11Q3SXB8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Colec11Q3SXB8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Colec11Q3SXB8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Colec11Q3SXB8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Colec11Q3SXB8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Colec11Q3SXB8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Colec11Q3SXB8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Colec11Q3SXB8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Colec11Q3SXB8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Colec11Q3SXB8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Colec11Q3SXB8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Colec11Q3SXB8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Colec11Q3SXB8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Colec11Q3SXB8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Colec11Q3SXB8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Colec11Q3SXB8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Colec11Q3SXB8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Colec11Q3SXB8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Colec11Q3SXB8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Colec11Q3SXB8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Colec11Q3SXB8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Colec11Q3SXB8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Colec11Q3SXB8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Colec11Q3SXB8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Colec11Q3SXB8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Colec11Q3SXB8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Colec11Q3SXB8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Colec11Q3SXB8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Colec11Q3SXB8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Colec11Q3SXB8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Colec11Q3SXB8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Colec11Q3SXB8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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