Protein–RNA interactions for Protein: Q2VLH6

Cd163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, mousemouse

Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd163Q2VLH6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd163Q2VLH6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd163Q2VLH6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd163Q2VLH6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd163Q2VLH6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd163Q2VLH6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd163Q2VLH6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd163Q2VLH6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd163Q2VLH6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd163Q2VLH6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd163Q2VLH6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd163Q2VLH6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd163Q2VLH6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd163Q2VLH6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd163Q2VLH6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd163Q2VLH6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd163Q2VLH6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd163Q2VLH6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd163Q2VLH6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd163Q2VLH6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd163Q2VLH6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd163Q2VLH6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd163Q2VLH6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd163Q2VLH6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd163Q2VLH6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd163Q2VLH6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd163Q2VLH6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cd163Q2VLH6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cd163Q2VLH6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd163Q2VLH6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd163Q2VLH6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd163Q2VLH6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd163Q2VLH6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd163Q2VLH6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd163Q2VLH6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd163Q2VLH6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd163Q2VLH6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd163Q2VLH6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd163Q2VLH6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd163Q2VLH6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd163Q2VLH6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd163Q2VLH6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd163Q2VLH6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd163Q2VLH6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd163Q2VLH6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd163Q2VLH6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd163Q2VLH6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd163Q2VLH6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd163Q2VLH6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd163Q2VLH6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd163Q2VLH6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd163Q2VLH6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd163Q2VLH6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd163Q2VLH6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd163Q2VLH6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd163Q2VLH6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd163Q2VLH6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd163Q2VLH6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd163Q2VLH6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd163Q2VLH6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd163Q2VLH6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd163Q2VLH6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd163Q2VLH6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd163Q2VLH6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd163Q2VLH6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd163Q2VLH6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd163Q2VLH6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd163Q2VLH6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd163Q2VLH6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd163Q2VLH6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd163Q2VLH6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd163Q2VLH6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd163Q2VLH6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd163Q2VLH6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd163Q2VLH6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cd163Q2VLH6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd163Q2VLH6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cd163Q2VLH6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Cd163Q2VLH6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd163Q2VLH6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd163Q2VLH6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd163Q2VLH6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd163Q2VLH6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd163Q2VLH6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd163Q2VLH6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd163Q2VLH6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd163Q2VLH6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd163Q2VLH6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd163Q2VLH6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd163Q2VLH6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd163Q2VLH6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd163Q2VLH6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd163Q2VLH6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd163Q2VLH6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd163Q2VLH6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd163Q2VLH6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd163Q2VLH6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd163Q2VLH6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd163Q2VLH6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd163Q2VLH6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms