Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gbp8Q2V6D6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gbp8Q2V6D6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gbp8Q2V6D6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gbp8Q2V6D6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gbp8Q2V6D6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbp8Q2V6D6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbp8Q2V6D6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbp8Q2V6D6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbp8Q2V6D6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbp8Q2V6D6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gbp8Q2V6D6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gbp8Q2V6D6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gbp8Q2V6D6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbp8Q2V6D6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbp8Q2V6D6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbp8Q2V6D6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbp8Q2V6D6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbp8Q2V6D6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbp8Q2V6D6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbp8Q2V6D6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbp8Q2V6D6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbp8Q2V6D6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gbp8Q2V6D6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gbp8Q2V6D6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gbp8Q2V6D6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gbp8Q2V6D6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gbp8Q2V6D6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gbp8Q2V6D6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gbp8Q2V6D6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gbp8Q2V6D6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gbp8Q2V6D6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gbp8Q2V6D6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gbp8Q2V6D6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Gbp8Q2V6D6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gbp8Q2V6D6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gbp8Q2V6D6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gbp8Q2V6D6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gbp8Q2V6D6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gbp8Q2V6D6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gbp8Q2V6D6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gbp8Q2V6D6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gbp8Q2V6D6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gbp8Q2V6D6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gbp8Q2V6D6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gbp8Q2V6D6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gbp8Q2V6D6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gbp8Q2V6D6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gbp8Q2V6D6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gbp8Q2V6D6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gbp8Q2V6D6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gbp8Q2V6D6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gbp8Q2V6D6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gbp8Q2V6D6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gbp8Q2V6D6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gbp8Q2V6D6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gbp8Q2V6D6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gbp8Q2V6D6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gbp8Q2V6D6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gbp8Q2V6D6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gbp8Q2V6D6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gbp8Q2V6D6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gbp8Q2V6D6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbp8Q2V6D6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbp8Q2V6D6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbp8Q2V6D6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbp8Q2V6D6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbp8Q2V6D6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbp8Q2V6D6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbp8Q2V6D6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbp8Q2V6D6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbp8Q2V6D6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbp8Q2V6D6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gbp8Q2V6D6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gbp8Q2V6D6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gbp8Q2V6D6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gbp8Q2V6D6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gbp8Q2V6D6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gbp8Q2V6D6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gbp8Q2V6D6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gbp8Q2V6D6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gbp8Q2V6D6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gbp8Q2V6D6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gbp8Q2V6D6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gbp8Q2V6D6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gbp8Q2V6D6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gbp8Q2V6D6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gbp8Q2V6D6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gbp8Q2V6D6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gbp8Q2V6D6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gbp8Q2V6D6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gbp8Q2V6D6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gbp8Q2V6D6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gbp8Q2V6D6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gbp8Q2V6D6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gbp8Q2V6D6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gbp8Q2V6D6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gbp8Q2V6D6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gbp8Q2V6D6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gbp8Q2V6D6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms