Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chrna5Q2MKA5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chrna5Q2MKA5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chrna5Q2MKA5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chrna5Q2MKA5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chrna5Q2MKA5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chrna5Q2MKA5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Chrna5Q2MKA5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Chrna5Q2MKA5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chrna5Q2MKA5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chrna5Q2MKA5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chrna5Q2MKA5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chrna5Q2MKA5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chrna5Q2MKA5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chrna5Q2MKA5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chrna5Q2MKA5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Chrna5Q2MKA5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chrna5Q2MKA5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chrna5Q2MKA5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chrna5Q2MKA5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Chrna5Q2MKA5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chrna5Q2MKA5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chrna5Q2MKA5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chrna5Q2MKA5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chrna5Q2MKA5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chrna5Q2MKA5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chrna5Q2MKA5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chrna5Q2MKA5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chrna5Q2MKA5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chrna5Q2MKA5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Chrna5Q2MKA5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chrna5Q2MKA5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chrna5Q2MKA5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chrna5Q2MKA5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Chrna5Q2MKA5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chrna5Q2MKA5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Chrna5Q2MKA5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Chrna5Q2MKA5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Chrna5Q2MKA5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Chrna5Q2MKA5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chrna5Q2MKA5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chrna5Q2MKA5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chrna5Q2MKA5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chrna5Q2MKA5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chrna5Q2MKA5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chrna5Q2MKA5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chrna5Q2MKA5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chrna5Q2MKA5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chrna5Q2MKA5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chrna5Q2MKA5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Chrna5Q2MKA5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Chrna5Q2MKA5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chrna5Q2MKA5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chrna5Q2MKA5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chrna5Q2MKA5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chrna5Q2MKA5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chrna5Q2MKA5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chrna5Q2MKA5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chrna5Q2MKA5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chrna5Q2MKA5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chrna5Q2MKA5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chrna5Q2MKA5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chrna5Q2MKA5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chrna5Q2MKA5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chrna5Q2MKA5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chrna5Q2MKA5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chrna5Q2MKA5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chrna5Q2MKA5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chrna5Q2MKA5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chrna5Q2MKA5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chrna5Q2MKA5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chrna5Q2MKA5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Chrna5Q2MKA5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chrna5Q2MKA5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chrna5Q2MKA5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chrna5Q2MKA5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chrna5Q2MKA5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chrna5Q2MKA5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chrna5Q2MKA5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chrna5Q2MKA5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chrna5Q2MKA5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chrna5Q2MKA5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chrna5Q2MKA5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chrna5Q2MKA5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chrna5Q2MKA5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chrna5Q2MKA5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chrna5Q2MKA5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chrna5Q2MKA5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chrna5Q2MKA5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chrna5Q2MKA5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Chrna5Q2MKA5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chrna5Q2MKA5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chrna5Q2MKA5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chrna5Q2MKA5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chrna5Q2MKA5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chrna5Q2MKA5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chrna5Q2MKA5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chrna5Q2MKA5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chrna5Q2MKA5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chrna5Q2MKA5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms