Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cpne9Q1RLL3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cpne9Q1RLL3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpne9Q1RLL3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpne9Q1RLL3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpne9Q1RLL3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpne9Q1RLL3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpne9Q1RLL3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpne9Q1RLL3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpne9Q1RLL3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpne9Q1RLL3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpne9Q1RLL3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne9Q1RLL3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne9Q1RLL3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne9Q1RLL3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne9Q1RLL3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne9Q1RLL3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne9Q1RLL3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne9Q1RLL3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne9Q1RLL3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne9Q1RLL3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpne9Q1RLL3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpne9Q1RLL3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpne9Q1RLL3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpne9Q1RLL3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpne9Q1RLL3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpne9Q1RLL3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpne9Q1RLL3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpne9Q1RLL3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpne9Q1RLL3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpne9Q1RLL3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpne9Q1RLL3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpne9Q1RLL3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpne9Q1RLL3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpne9Q1RLL3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpne9Q1RLL3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpne9Q1RLL3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpne9Q1RLL3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpne9Q1RLL3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpne9Q1RLL3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpne9Q1RLL3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpne9Q1RLL3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpne9Q1RLL3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpne9Q1RLL3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cpne9Q1RLL3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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