Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cers3Q1A3B0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cers3Q1A3B0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cers3Q1A3B0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cers3Q1A3B0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cers3Q1A3B0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cers3Q1A3B0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cers3Q1A3B0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cers3Q1A3B0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cers3Q1A3B0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cers3Q1A3B0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cers3Q1A3B0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cers3Q1A3B0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cers3Q1A3B0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cers3Q1A3B0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cers3Q1A3B0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Cers3Q1A3B0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cers3Q1A3B0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cers3Q1A3B0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cers3Q1A3B0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cers3Q1A3B0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cers3Q1A3B0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cers3Q1A3B0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cers3Q1A3B0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cers3Q1A3B0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cers3Q1A3B0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cers3Q1A3B0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cers3Q1A3B0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cers3Q1A3B0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cers3Q1A3B0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cers3Q1A3B0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cers3Q1A3B0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cers3Q1A3B0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Cers3Q1A3B0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cers3Q1A3B0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cers3Q1A3B0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cers3Q1A3B0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cers3Q1A3B0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cers3Q1A3B0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cers3Q1A3B0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cers3Q1A3B0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cers3Q1A3B0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cers3Q1A3B0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cers3Q1A3B0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cers3Q1A3B0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cers3Q1A3B0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cers3Q1A3B0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cers3Q1A3B0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cers3Q1A3B0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cers3Q1A3B0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cers3Q1A3B0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cers3Q1A3B0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cers3Q1A3B0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cers3Q1A3B0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cers3Q1A3B0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cers3Q1A3B0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cers3Q1A3B0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cers3Q1A3B0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Cers3Q1A3B0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cers3Q1A3B0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cers3Q1A3B0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Cers3Q1A3B0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cers3Q1A3B0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cers3Q1A3B0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cers3Q1A3B0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cers3Q1A3B0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Cers3Q1A3B0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cers3Q1A3B0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cers3Q1A3B0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cers3Q1A3B0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cers3Q1A3B0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cers3Q1A3B0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Cers3Q1A3B0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cers3Q1A3B0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cers3Q1A3B0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cers3Q1A3B0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cers3Q1A3B0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cers3Q1A3B0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cers3Q1A3B0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cers3Q1A3B0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cers3Q1A3B0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cers3Q1A3B0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cers3Q1A3B0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cers3Q1A3B0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cers3Q1A3B0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cers3Q1A3B0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cers3Q1A3B0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cers3Q1A3B0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cers3Q1A3B0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cers3Q1A3B0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cers3Q1A3B0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Cers3Q1A3B0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cers3Q1A3B0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cers3Q1A3B0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cers3Q1A3B0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cers3Q1A3B0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cers3Q1A3B0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cers3Q1A3B0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cers3Q1A3B0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cers3Q1A3B0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms