Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpusd3Q14AI6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpusd3Q14AI6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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