Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spatc1Q148B6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spatc1Q148B6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spatc1Q148B6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spatc1Q148B6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spatc1Q148B6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spatc1Q148B6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spatc1Q148B6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spatc1Q148B6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spatc1Q148B6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spatc1Q148B6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spatc1Q148B6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spatc1Q148B6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spatc1Q148B6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spatc1Q148B6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spatc1Q148B6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spatc1Q148B6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spatc1Q148B6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spatc1Q148B6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spatc1Q148B6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spatc1Q148B6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spatc1Q148B6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Spatc1Q148B6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spatc1Q148B6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spatc1Q148B6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Spatc1Q148B6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spatc1Q148B6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spatc1Q148B6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spatc1Q148B6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spatc1Q148B6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spatc1Q148B6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spatc1Q148B6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spatc1Q148B6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spatc1Q148B6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spatc1Q148B6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spatc1Q148B6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spatc1Q148B6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spatc1Q148B6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spatc1Q148B6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spatc1Q148B6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spatc1Q148B6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spatc1Q148B6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spatc1Q148B6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spatc1Q148B6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spatc1Q148B6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spatc1Q148B6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spatc1Q148B6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spatc1Q148B6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spatc1Q148B6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spatc1Q148B6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spatc1Q148B6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spatc1Q148B6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spatc1Q148B6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spatc1Q148B6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spatc1Q148B6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spatc1Q148B6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spatc1Q148B6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spatc1Q148B6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spatc1Q148B6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spatc1Q148B6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Spatc1Q148B6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spatc1Q148B6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Spatc1Q148B6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spatc1Q148B6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spatc1Q148B6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spatc1Q148B6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spatc1Q148B6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spatc1Q148B6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Spatc1Q148B6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spatc1Q148B6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spatc1Q148B6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spatc1Q148B6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spatc1Q148B6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spatc1Q148B6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Spatc1Q148B6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spatc1Q148B6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spatc1Q148B6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spatc1Q148B6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spatc1Q148B6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spatc1Q148B6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spatc1Q148B6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Spatc1Q148B6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spatc1Q148B6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spatc1Q148B6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spatc1Q148B6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spatc1Q148B6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Spatc1Q148B6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Spatc1Q148B6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Spatc1Q148B6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spatc1Q148B6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spatc1Q148B6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spatc1Q148B6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spatc1Q148B6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spatc1Q148B6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spatc1Q148B6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spatc1Q148B6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Spatc1Q148B6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spatc1Q148B6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms