Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Itgb8Q0VBD0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Itgb8Q0VBD0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Itgb8Q0VBD0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Itgb8Q0VBD0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Itgb8Q0VBD0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Itgb8Q0VBD0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Itgb8Q0VBD0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Itgb8Q0VBD0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Itgb8Q0VBD0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Itgb8Q0VBD0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Itgb8Q0VBD0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Itgb8Q0VBD0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Itgb8Q0VBD0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Itgb8Q0VBD0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Itgb8Q0VBD0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Itgb8Q0VBD0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Itgb8Q0VBD0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Itgb8Q0VBD0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Itgb8Q0VBD0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Itgb8Q0VBD0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Itgb8Q0VBD0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Itgb8Q0VBD0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Itgb8Q0VBD0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Itgb8Q0VBD0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Itgb8Q0VBD0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Itgb8Q0VBD0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Itgb8Q0VBD0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Itgb8Q0VBD0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Itgb8Q0VBD0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Itgb8Q0VBD0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Itgb8Q0VBD0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Itgb8Q0VBD0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Itgb8Q0VBD0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Itgb8Q0VBD0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Itgb8Q0VBD0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Itgb8Q0VBD0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Itgb8Q0VBD0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Itgb8Q0VBD0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Itgb8Q0VBD0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Itgb8Q0VBD0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Itgb8Q0VBD0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Itgb8Q0VBD0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Itgb8Q0VBD0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Itgb8Q0VBD0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Itgb8Q0VBD0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Itgb8Q0VBD0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Itgb8Q0VBD0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Itgb8Q0VBD0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Itgb8Q0VBD0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Itgb8Q0VBD0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Itgb8Q0VBD0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Itgb8Q0VBD0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Itgb8Q0VBD0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Itgb8Q0VBD0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Itgb8Q0VBD0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Itgb8Q0VBD0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Itgb8Q0VBD0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Itgb8Q0VBD0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Itgb8Q0VBD0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Itgb8Q0VBD0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Itgb8Q0VBD0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Itgb8Q0VBD0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Itgb8Q0VBD0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Itgb8Q0VBD0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Itgb8Q0VBD0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Itgb8Q0VBD0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Itgb8Q0VBD0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Itgb8Q0VBD0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Itgb8Q0VBD0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Itgb8Q0VBD0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Itgb8Q0VBD0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Itgb8Q0VBD0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Itgb8Q0VBD0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Itgb8Q0VBD0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Itgb8Q0VBD0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms