Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cntnap5cQ0V8T7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cntnap5cQ0V8T7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cntnap5cQ0V8T7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cntnap5cQ0V8T7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cntnap5cQ0V8T7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cntnap5cQ0V8T7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cntnap5cQ0V8T7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cntnap5cQ0V8T7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cntnap5cQ0V8T7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cntnap5cQ0V8T7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cntnap5cQ0V8T7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cntnap5cQ0V8T7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cntnap5cQ0V8T7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cntnap5cQ0V8T7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cntnap5cQ0V8T7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cntnap5cQ0V8T7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cntnap5cQ0V8T7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cntnap5cQ0V8T7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cntnap5cQ0V8T7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cntnap5cQ0V8T7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cntnap5cQ0V8T7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cntnap5cQ0V8T7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cntnap5cQ0V8T7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cntnap5cQ0V8T7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cntnap5cQ0V8T7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cntnap5cQ0V8T7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cntnap5cQ0V8T7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cntnap5cQ0V8T7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cntnap5cQ0V8T7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cntnap5cQ0V8T7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cntnap5cQ0V8T7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cntnap5cQ0V8T7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cntnap5cQ0V8T7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cntnap5cQ0V8T7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cntnap5cQ0V8T7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cntnap5cQ0V8T7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cntnap5cQ0V8T7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cntnap5cQ0V8T7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cntnap5cQ0V8T7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cntnap5cQ0V8T7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cntnap5cQ0V8T7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cntnap5cQ0V8T7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cntnap5cQ0V8T7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cntnap5cQ0V8T7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cntnap5cQ0V8T7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cntnap5cQ0V8T7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cntnap5cQ0V8T7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cntnap5cQ0V8T7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cntnap5cQ0V8T7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cntnap5cQ0V8T7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cntnap5cQ0V8T7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cntnap5cQ0V8T7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cntnap5cQ0V8T7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cntnap5cQ0V8T7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cntnap5cQ0V8T7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cntnap5cQ0V8T7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cntnap5cQ0V8T7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cntnap5cQ0V8T7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cntnap5cQ0V8T7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cntnap5cQ0V8T7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cntnap5cQ0V8T7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cntnap5cQ0V8T7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cntnap5cQ0V8T7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cntnap5cQ0V8T7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cntnap5cQ0V8T7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cntnap5cQ0V8T7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cntnap5cQ0V8T7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cntnap5cQ0V8T7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cntnap5cQ0V8T7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cntnap5cQ0V8T7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cntnap5cQ0V8T7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cntnap5cQ0V8T7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cntnap5cQ0V8T7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cntnap5cQ0V8T7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cntnap5cQ0V8T7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cntnap5cQ0V8T7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cntnap5cQ0V8T7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cntnap5cQ0V8T7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cntnap5cQ0V8T7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cntnap5cQ0V8T7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cntnap5cQ0V8T7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cntnap5cQ0V8T7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cntnap5cQ0V8T7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cntnap5cQ0V8T7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cntnap5cQ0V8T7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cntnap5cQ0V8T7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cntnap5cQ0V8T7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntnap5cQ0V8T7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntnap5cQ0V8T7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntnap5cQ0V8T7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms