Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Znf541Q0GGX2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Znf541Q0GGX2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Znf541Q0GGX2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Znf541Q0GGX2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Znf541Q0GGX2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Znf541Q0GGX2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Znf541Q0GGX2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Znf541Q0GGX2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Znf541Q0GGX2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Znf541Q0GGX2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Znf541Q0GGX2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Znf541Q0GGX2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Znf541Q0GGX2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Znf541Q0GGX2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Znf541Q0GGX2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Znf541Q0GGX2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Znf541Q0GGX2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Znf541Q0GGX2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Znf541Q0GGX2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Znf541Q0GGX2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Znf541Q0GGX2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Znf541Q0GGX2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Znf541Q0GGX2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Znf541Q0GGX2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Znf541Q0GGX2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Znf541Q0GGX2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Znf541Q0GGX2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Znf541Q0GGX2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Znf541Q0GGX2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Znf541Q0GGX2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Znf541Q0GGX2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Znf541Q0GGX2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Znf541Q0GGX2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Znf541Q0GGX2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Znf541Q0GGX2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Znf541Q0GGX2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Znf541Q0GGX2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Znf541Q0GGX2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Znf541Q0GGX2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Znf541Q0GGX2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Znf541Q0GGX2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Znf541Q0GGX2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Znf541Q0GGX2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Znf541Q0GGX2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Znf541Q0GGX2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Znf541Q0GGX2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Znf541Q0GGX2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Znf541Q0GGX2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Znf541Q0GGX2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Znf541Q0GGX2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Znf541Q0GGX2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Znf541Q0GGX2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Znf541Q0GGX2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Znf541Q0GGX2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Znf541Q0GGX2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Znf541Q0GGX2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Znf541Q0GGX2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Znf541Q0GGX2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Znf541Q0GGX2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Znf541Q0GGX2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Znf541Q0GGX2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Znf541Q0GGX2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Znf541Q0GGX2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Znf541Q0GGX2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Znf541Q0GGX2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Znf541Q0GGX2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Znf541Q0GGX2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Znf541Q0GGX2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Znf541Q0GGX2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Znf541Q0GGX2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Znf541Q0GGX2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Znf541Q0GGX2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Znf541Q0GGX2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Znf541Q0GGX2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Znf541Q0GGX2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Znf541Q0GGX2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Znf541Q0GGX2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Znf541Q0GGX2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Znf541Q0GGX2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Znf541Q0GGX2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Znf541Q0GGX2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Znf541Q0GGX2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Znf541Q0GGX2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Znf541Q0GGX2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Znf541Q0GGX2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Znf541Q0GGX2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Znf541Q0GGX2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Znf541Q0GGX2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Znf541Q0GGX2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Znf541Q0GGX2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Znf541Q0GGX2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Znf541Q0GGX2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Znf541Q0GGX2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Znf541Q0GGX2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Znf541Q0GGX2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Znf541Q0GGX2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Znf541Q0GGX2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Znf541Q0GGX2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Znf541Q0GGX2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms