Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cass4Q08EC4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cass4Q08EC4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cass4Q08EC4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cass4Q08EC4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cass4Q08EC4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cass4Q08EC4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cass4Q08EC4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cass4Q08EC4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cass4Q08EC4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cass4Q08EC4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cass4Q08EC4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cass4Q08EC4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cass4Q08EC4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cass4Q08EC4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cass4Q08EC4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cass4Q08EC4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cass4Q08EC4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cass4Q08EC4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cass4Q08EC4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cass4Q08EC4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cass4Q08EC4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cass4Q08EC4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cass4Q08EC4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cass4Q08EC4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cass4Q08EC4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cass4Q08EC4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cass4Q08EC4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cass4Q08EC4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cass4Q08EC4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cass4Q08EC4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cass4Q08EC4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cass4Q08EC4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cass4Q08EC4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cass4Q08EC4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cass4Q08EC4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cass4Q08EC4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cass4Q08EC4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Cass4Q08EC4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cass4Q08EC4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cass4Q08EC4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cass4Q08EC4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cass4Q08EC4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Cass4Q08EC4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cass4Q08EC4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cass4Q08EC4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cass4Q08EC4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cass4Q08EC4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cass4Q08EC4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cass4Q08EC4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cass4Q08EC4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms