Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q08AU9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q08AU9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q08AU9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q08AU9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q08AU9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q08AU9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q08AU9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q08AU9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q08AU9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q08AU9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q08AU9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q08AU9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q08AU9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q08AU9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q08AU9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q08AU9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q08AU9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q08AU9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q08AU9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q08AU9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q08AU9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q08AU9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q08AU9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q08AU9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q08AU9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q08AU9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q08AU9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q08AU9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q08AU9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q08AU9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q08AU9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q08AU9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q08AU9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q08AU9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Q08AU9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q08AU9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q08AU9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q08AU9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q08AU9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q08AU9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q08AU9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q08AU9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q08AU9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q08AU9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q08AU9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q08AU9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q08AU9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q08AU9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q08AU9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q08AU9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q08AU9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Q08AU9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q08AU9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q08AU9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q08AU9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q08AU9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q08AU9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q08AU9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q08AU9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q08AU9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q08AU9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q08AU9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q08AU9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q08AU9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Q08AU9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q08AU9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q08AU9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q08AU9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q08AU9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Q08AU9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q08AU9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q08AU9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q08AU9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q08AU9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q08AU9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q08AU9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q08AU9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q08AU9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q08AU9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q08AU9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q08AU9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q08AU9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q08AU9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q08AU9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q08AU9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q08AU9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Q08AU9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q08AU9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q08AU9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Q08AU9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Q08AU9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q08AU9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q08AU9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q08AU9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q08AU9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q08AU9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q08AU9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q08AU9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q08AU9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms