Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nfe2Q07279 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nfe2Q07279 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nfe2Q07279 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nfe2Q07279 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nfe2Q07279 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nfe2Q07279 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nfe2Q07279 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nfe2Q07279 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nfe2Q07279 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nfe2Q07279 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nfe2Q07279 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nfe2Q07279 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nfe2Q07279 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nfe2Q07279 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nfe2Q07279 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nfe2Q07279 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nfe2Q07279 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nfe2Q07279 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nfe2Q07279 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nfe2Q07279 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nfe2Q07279 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nfe2Q07279 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nfe2Q07279 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nfe2Q07279 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Nfe2Q07279 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nfe2Q07279 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Nfe2Q07279 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nfe2Q07279 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nfe2Q07279 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nfe2Q07279 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nfe2Q07279 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nfe2Q07279 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nfe2Q07279 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nfe2Q07279 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Nfe2Q07279 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nfe2Q07279 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nfe2Q07279 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nfe2Q07279 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nfe2Q07279 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nfe2Q07279 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nfe2Q07279 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nfe2Q07279 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nfe2Q07279 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nfe2Q07279 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nfe2Q07279 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nfe2Q07279 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Nfe2Q07279 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nfe2Q07279 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nfe2Q07279 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nfe2Q07279 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nfe2Q07279 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nfe2Q07279 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nfe2Q07279 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nfe2Q07279 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nfe2Q07279 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nfe2Q07279 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nfe2Q07279 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nfe2Q07279 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nfe2Q07279 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nfe2Q07279 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nfe2Q07279 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nfe2Q07279 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nfe2Q07279 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nfe2Q07279 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nfe2Q07279 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nfe2Q07279 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nfe2Q07279 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nfe2Q07279 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nfe2Q07279 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nfe2Q07279 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Nfe2Q07279 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nfe2Q07279 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nfe2Q07279 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nfe2Q07279 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nfe2Q07279 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nfe2Q07279 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nfe2Q07279 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Nfe2Q07279 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nfe2Q07279 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nfe2Q07279 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nfe2Q07279 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nfe2Q07279 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nfe2Q07279 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nfe2Q07279 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nfe2Q07279 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nfe2Q07279 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nfe2Q07279 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nfe2Q07279 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nfe2Q07279 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nfe2Q07279 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nfe2Q07279 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nfe2Q07279 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nfe2Q07279 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nfe2Q07279 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nfe2Q07279 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nfe2Q07279 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nfe2Q07279 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nfe2Q07279 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nfe2Q07279 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms