Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gdf3Q07104 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gdf3Q07104 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gdf3Q07104 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gdf3Q07104 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gdf3Q07104 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gdf3Q07104 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gdf3Q07104 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gdf3Q07104 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gdf3Q07104 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gdf3Q07104 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gdf3Q07104 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gdf3Q07104 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gdf3Q07104 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gdf3Q07104 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gdf3Q07104 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gdf3Q07104 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gdf3Q07104 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gdf3Q07104 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gdf3Q07104 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gdf3Q07104 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gdf3Q07104 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gdf3Q07104 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gdf3Q07104 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gdf3Q07104 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gdf3Q07104 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gdf3Q07104 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gdf3Q07104 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gdf3Q07104 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gdf3Q07104 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gdf3Q07104 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gdf3Q07104 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gdf3Q07104 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gdf3Q07104 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gdf3Q07104 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gdf3Q07104 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gdf3Q07104 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gdf3Q07104 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Gdf3Q07104 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gdf3Q07104 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gdf3Q07104 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gdf3Q07104 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Gdf3Q07104 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gdf3Q07104 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gdf3Q07104 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gdf3Q07104 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gdf3Q07104 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gdf3Q07104 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gdf3Q07104 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gdf3Q07104 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gdf3Q07104 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Gdf3Q07104 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gdf3Q07104 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gdf3Q07104 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gdf3Q07104 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gdf3Q07104 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Gdf3Q07104 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gdf3Q07104 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gdf3Q07104 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gdf3Q07104 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gdf3Q07104 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gdf3Q07104 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gdf3Q07104 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gdf3Q07104 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gdf3Q07104 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gdf3Q07104 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gdf3Q07104 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gdf3Q07104 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gdf3Q07104 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gdf3Q07104 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gdf3Q07104 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gdf3Q07104 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gdf3Q07104 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gdf3Q07104 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gdf3Q07104 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gdf3Q07104 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gdf3Q07104 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gdf3Q07104 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gdf3Q07104 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gdf3Q07104 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gdf3Q07104 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gdf3Q07104 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gdf3Q07104 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gdf3Q07104 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gdf3Q07104 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gdf3Q07104 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gdf3Q07104 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gdf3Q07104 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gdf3Q07104 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gdf3Q07104 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gdf3Q07104 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gdf3Q07104 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gdf3Q07104 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gdf3Q07104 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gdf3Q07104 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gdf3Q07104 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gdf3Q07104 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gdf3Q07104 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gdf3Q07104 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Gdf3Q07104 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms