Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3bp2Q06649 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3bp2Q06649 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3bp2Q06649 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Sh3bp2Q06649 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sh3bp2Q06649 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3bp2Q06649 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3bp2Q06649 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3bp2Q06649 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3bp2Q06649 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3bp2Q06649 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3bp2Q06649 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3bp2Q06649 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3bp2Q06649 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3bp2Q06649 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3bp2Q06649 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3bp2Q06649 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3bp2Q06649 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3bp2Q06649 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3bp2Q06649 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp2Q06649 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp2Q06649 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp2Q06649 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp2Q06649 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp2Q06649 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3bp2Q06649 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3bp2Q06649 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3bp2Q06649 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp2Q06649 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp2Q06649 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp2Q06649 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp2Q06649 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp2Q06649 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp2Q06649 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3bp2Q06649 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3bp2Q06649 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3bp2Q06649 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3bp2Q06649 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3bp2Q06649 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3bp2Q06649 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3bp2Q06649 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3bp2Q06649 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3bp2Q06649 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3bp2Q06649 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3bp2Q06649 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3bp2Q06649 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3bp2Q06649 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3bp2Q06649 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3bp2Q06649 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3bp2Q06649 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3bp2Q06649 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sh3bp2Q06649 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sh3bp2Q06649 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sh3bp2Q06649 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3bp2Q06649 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3bp2Q06649 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3bp2Q06649 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3bp2Q06649 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3bp2Q06649 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3bp2Q06649 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3bp2Q06649 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3bp2Q06649 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp2Q06649 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp2Q06649 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp2Q06649 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp2Q06649 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp2Q06649 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp2Q06649 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp2Q06649 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp2Q06649 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp2Q06649 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp2Q06649 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3bp2Q06649 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3bp2Q06649 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3bp2Q06649 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3bp2Q06649 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3bp2Q06649 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3bp2Q06649 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3bp2Q06649 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3bp2Q06649 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3bp2Q06649 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3bp2Q06649 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3bp2Q06649 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3bp2Q06649 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3bp2Q06649 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3bp2Q06649 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3bp2Q06649 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3bp2Q06649 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3bp2Q06649 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3bp2Q06649 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3bp2Q06649 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3bp2Q06649 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3bp2Q06649 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3bp2Q06649 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3bp2Q06649 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3bp2Q06649 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3bp2Q06649 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3bp2Q06649 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3bp2Q06649 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3bp2Q06649 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms