Protein–RNA interactions for Protein: Q05CL8

Larp7, La-related protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp7Q05CL8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Larp7Q05CL8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Larp7Q05CL8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Larp7Q05CL8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Larp7Q05CL8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Larp7Q05CL8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Larp7Q05CL8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Larp7Q05CL8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Larp7Q05CL8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Larp7Q05CL8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Larp7Q05CL8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Larp7Q05CL8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Larp7Q05CL8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Larp7Q05CL8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Larp7Q05CL8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Larp7Q05CL8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Larp7Q05CL8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Larp7Q05CL8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Larp7Q05CL8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Larp7Q05CL8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Larp7Q05CL8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Larp7Q05CL8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Larp7Q05CL8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Larp7Q05CL8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Larp7Q05CL8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Larp7Q05CL8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Larp7Q05CL8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Larp7Q05CL8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Larp7Q05CL8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Larp7Q05CL8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Larp7Q05CL8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Larp7Q05CL8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Larp7Q05CL8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Larp7Q05CL8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Larp7Q05CL8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Larp7Q05CL8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Larp7Q05CL8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Larp7Q05CL8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Larp7Q05CL8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Larp7Q05CL8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Larp7Q05CL8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Larp7Q05CL8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Larp7Q05CL8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Larp7Q05CL8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Larp7Q05CL8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Larp7Q05CL8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Larp7Q05CL8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Larp7Q05CL8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Larp7Q05CL8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Larp7Q05CL8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Larp7Q05CL8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Larp7Q05CL8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Larp7Q05CL8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Larp7Q05CL8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Larp7Q05CL8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Larp7Q05CL8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Larp7Q05CL8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Larp7Q05CL8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Larp7Q05CL8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Larp7Q05CL8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Larp7Q05CL8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Larp7Q05CL8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Larp7Q05CL8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Larp7Q05CL8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Larp7Q05CL8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Larp7Q05CL8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Larp7Q05CL8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Larp7Q05CL8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Larp7Q05CL8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Larp7Q05CL8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Larp7Q05CL8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Larp7Q05CL8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Larp7Q05CL8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Larp7Q05CL8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Larp7Q05CL8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Larp7Q05CL8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Larp7Q05CL8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Larp7Q05CL8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Larp7Q05CL8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Larp7Q05CL8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Larp7Q05CL8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Larp7Q05CL8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Larp7Q05CL8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Larp7Q05CL8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Larp7Q05CL8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Larp7Q05CL8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Larp7Q05CL8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Larp7Q05CL8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Larp7Q05CL8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Larp7Q05CL8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Larp7Q05CL8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Larp7Q05CL8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Larp7Q05CL8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Larp7Q05CL8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Larp7Q05CL8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Larp7Q05CL8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Larp7Q05CL8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Larp7Q05CL8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Larp7Q05CL8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Larp7Q05CL8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms